关键词： 生物信息学   磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1   胆管癌   生物学行为   机制  

摘要： 目的：本研究旨在结合生物信息学探讨磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1（phosphoenolpyruvate carboxykinase1，PCK1）在胆管癌细胞中的表达，及其对胆管癌细胞增殖、迁移的影响及潜在机制。方法：基于GEO数据库中胆管癌mRNA测序数据筛选差异表达基因。通过STRING网站及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质互相作用网络（PPI网络），并筛选关键调控网络及基因。通过TCGA数据库及HPA数据库验证关键基因表达量及病理学特征。通过KEGG及GSEA富集分析探究差异基因相关功能及PCK1相关通路。细胞学实验中采用慢病毒转染胆管癌RBE细胞株以过表达PCK1，采用RT-qPCR及蛋白质印迹法验证转染效率。将实验分为阴性对照组（RBE组）、空转组（RBE-NC组）、过表达组（RBE-OE组）及PPARγ抑制剂组（RBE-OE+GW9662组）。采用集落形成实验及CCK8法检测细胞增殖能力，采用划痕愈合实验及Transwell实验检测细胞迁移能力，采用蛋白质印迹检测通路蛋白表达水平。结果：生物信息学分析显示PCK1可以作为胆管癌的关键调控基因，在癌组织中表达水平较低，可能通过PPAR通路发挥作用。细胞学实验显示：RBE细胞经转染后，PCK1 mRNA和蛋白表达水平显著升高。与阴性对照组相比，过表达PCK1抑制RBE细胞体外增殖和迁移能力，同时PPARγ、PTEN蛋白表达升高，而p-mTOR/mTOR水平降低，而抑制剂组则可逆转上述趋势。结论：PCK1可以作为胆管癌的关键调控基因，并可能通路激活PPARγ/PTEN/mTOR信号通路抑制胆管癌增殖及迁移。

关键词： 子痫前期   低氧   外泌体   滋养细胞   miR-141-3p  

摘要： 目的：研究低氧环境诱导外泌体释放miR-141-3p，并调控滋养细胞的生物学功能，为进一步研究miR-141-3p在子痫前期发病机制中的作用提供理论基础。方法：采用体外培养人绒毛膜滋养细胞HTR-8/SVneo，并将其分为常氧组和低氧组。通过使用CCK-8实验、克隆形成实验评估各组细胞的增殖活性；使用Transwell实验评估各组细胞侵袭和迁移能力；使用Western blot（蛋白质印记法）技术检测外泌体的存在；使用透射电镜技术（TEM）观察分离得到的外泌体的分子形态；通过纳米颗粒跟踪分析仪（NTA）检测外泌体的粒径和浓度；使用qRT-PCR检测各组细胞和外泌体中miR-141-3p的表达水平。结果：对比常氧组，低氧组的HTR-8/SVneo细胞和外泌体中的miR-141-3p表达量升高，低氧组细胞的增殖活性和迁移、侵袭能力下降，而常氧组细胞的miR-141-3p表达量下降，增殖活性增加，侵袭细胞数量增多（P<0.01）；使用Western blot检测外泌体标志蛋白呈强阳性表达。结论：低氧条件下，外泌体中的miR-141-3p的表达水平上调，抑制细胞的增殖和侵袭、迁移能力。外泌体源性miR-141-3p可以调节滋养细胞的生物学功能。

关键词： 云杉   叶枯病   病原鉴定   Nothophoma quercina   生物学特性   药剂筛选   防效  

摘要： 为明确引起云杉（Picea asperata Mast.）叶枯病的病原，在辽宁省大连市采集云杉针叶病样，采用组织分离法进行病原分离，应用柯赫氏法则验证病菌的致病性。进一步通过形态学观察，多基因（ITS-RPB2-TUB2-LSU）联合系统发育分析，确定其病原菌为Nothophoma quercina。测定***在不同培养基、碳源、氮源、温度、光照、pH值条件下的生长情况，结果表明以可溶性淀粉为碳源、尿素为氮源的SDA培养基，25℃、pH 7.0、光暗交替条件（12 h光照/12 h黑暗）最适合该菌菌丝生长。选取10种药剂对***进行室内毒力试验，发现98%吡唑醚菌酯原药（TC）对***的抑菌效果最好，EC50值为0.0196 μg·mL-1。在室内药效测定基础上筛选出5种抑制效果较好的药剂进行进一步的田间防效试验，结果表明，250 g·L-1吡唑醚菌酯乳油（EC）的防效最好，7月份和9月份的防效均达到65%以上。研究结果为进一步揭示云杉叶枯病的发生规律以及化学防控奠定了基础。

关键词： 环境微生物学   教学改革   课程目标   教学效果评价  

摘要： 环境微生物学是面向环境科学专业本科生开设的专业核心课程，在“新工科”新质人才培养中发挥重要作用。近年来，我们对环境微生物学课程在理论、实践及课程思政等方面存在的问题进行了认真反思，通过构建课程思政案例库、革新教学内容、优化教学方法及实践教学内容、重构课程考核体系等举措，进行教学改革，以提升学生思想道德素质和实践能力。经过3年教改实践和探索，学生课程目标达成度均高于期望值，终结性考核优秀率不断提高，学生、同行及督导评价明显提升，课程教学改革取得良好成效。

关键词： 稗属炭疽菌   微生物除草剂   生物学特性   基因组测序分析   次级代谢产物  

摘要： 【背景】稗草生防真菌稗属炭疽菌（Colletotrichum echinochloae）B-48菌株是从水稻田自然发病的稗草上分离鉴定得到的，前期研究发现该菌株对稗草具有良好的生防效果，对主要作物如水稻、小麦、玉米等具有良好的安全性。【目的】研究稗草生防真菌B-48菌株的最佳生长和产孢的培养基、生长温度、pH、光照条件、碳氮源等生物学特性，以便优化该菌株的培养和应用条件。解析该生防菌株的基因组序列信息，挖掘其次级代谢产物基因资源，为深入研究该菌株的除草活性天然产物及生物合成机制奠定基础。【方法】对稗草生防真菌B-48菌株的生长最适培养基、温度、pH、光照、最适生长碳氮源、致死温度等生物学特性进行研究。利用Nanopore及Illumina测序平台对稗草病原真菌B-48菌株进行全基因组测序，采用相关软件进行菌株基因组序列拼接、基因组结构预测，以及基因组功能注释、并预测其次级代谢产物合成基因簇。【结果】稗草生防真菌B-48菌株在PSA培养基上生长产孢良好，最适生长温度为30 ℃，最适生长pH为7.0，最适光照条件为持续光照，最适碳氮源分别为淀粉、酵母浸膏，致死条件为55 ℃、10 min。全基因组序列结果显示该菌株基因组大小62.25 Mbp，GC含量46.59%，预测到蛋白质编码基因11 324个，预测到次级代谢产物生物合成基因簇76个。【结论】稗属炭疽菌B-48菌株具有开发为稗草生物除草剂的潜力，其次级代谢产物生物合成基因簇预示着其具有合成除草活性天然产物的潜力。以上结果为该菌后续发酵培养、次级代谢生物合成研究及实际应用奠定了理论基础。

关键词： 合成生物学   蛋白质折叠   蛋白质设计   教学方法   人才培养  

摘要： 合成生物学旨在通过构建人工生物系统来理解生命和设计生命，是新一轮科技革命和产业变革的新引擎。为了适应合成生物学前沿知识与传统生物科学框架的融汇交叉，本文聚焦全新设置的合成生物学课程中元件开发与设计基础知识的教学现状，提出理论传授与Foldit实践操作的有机结合方式，增强学生对“蛋白质元件折叠与设计”的掌握与运用。从课程设计、教学方法等方面进行探讨，提出智能软件辅助解决课程难点的策略。创新的教学模式有效促进了学生在蛋白质设计前沿领域的创新能力与实践技能的发展，对于培养适应未来科技挑战的生物科学人才具有重要意义。

关键词： 硝酸盐还原酶   结构   反应机理   基因调控   环境因子  

摘要： 硝酸盐是全球氮循环的关键组成部分，同时也是植物有效氮的重要来源。研究硝酸盐的转化过程对于生态系统生产力的提高有重要意义，而自然环境中硝酸盐的转化主要是硝酸盐的异化还原。同时，硝态氮的大量输入导致了诸多环境生态问题，引起人们广泛关注。反硝化反应是环境中硝态氮去除的主要过程。硝酸盐异化还原是反硝化过程硝态氮去除的第一步，可以为后续的还原反应提供反应底物。研究硝酸盐还原过程还可以加深对微生物脱氮的理解。硝酸盐异化还原由膜结合硝酸盐还原酶(Nar)和周质型硝酸盐还原酶(Nap)共同催化，但二者在结构、细胞定位、反应机理以及基因调控等方面存在差异，并且二者对于环境因子的响应也不尽相同，因此可能在催化硝酸盐还原过程中存在一定的差异性。本文系统论述了硝酸盐还原酶Nar与Nap在上述几方面的异同，以提升对系统中硝酸盐发展动态的认识。

关键词： 大豆叶斑病   高粱附球菌   生物学特性  

摘要： 2023年在黑龙江省绥化市肇源县首次发现由高粱附球菌(Epicoccum sorghinum)侵染引起的大豆叶斑病,为明确病原菌生物学特性,科学指导病害防控,采用生长速率法研究不同营养及环境条件对病菌生长及产孢的影响。结果表明:菌丝生长和产孢最适培养基为燕麦培养基;菌丝生长,最适碳源为麦芽糖、氮源为蛋白胨,最适温度为25℃、p H为6,致死温度为53℃、15 min;产孢,最适碳源为葡萄糖、氮源为尿素,最适温度为28℃、pH为7。光照对菌丝生长无影响,全黑暗条件促进产孢。

关键词： colorectal   stratification   prompt  

摘要： Radiomics,with its transformative potential for predicting colorectal cancer(CRC)prognosis,encounters challenges in clinical translation due to the unclear biological basis of risk stratification[1].Bridging this gap is pivotal,and the emerging field of radiogenomics,situated at the intersection of radiomics and genomics,presents an opportunity to unravel the intricate relationship between imaging representations and molecular pathway dysregulation[2,3].However,one-way association analyses have provided insufficient evidence,prompting the need for a multi-phase radiogenomics *** strategy encompasses(1)the employment of tightly integrated forward and reverse radiogenomics engineering approaches[4],(2)the verification of micro–macro level biological associations[5],and(3)the validation of the radiomics signature across different datasets[6].

关键词： 分子生物学   教学改革   创新实验班   优化与创新  

摘要： “分子生物学”课程紧跟科学前沿,涵盖基因组学、蛋白质组学等新兴领域,注重实验操作技能的培养。新农科农学创新实验班是河南农业大学为培养农业现代化的精英人才设立,“分子生物学”是其培养方案中的核心必修课程。从新农科农学创新实验班的培养目标出发,分析目前教学过程中存在的问题,提出相应的教学改革措施,并为提升农学专业的教学效果提供思路和方法,为培养科研素养高和具有国际化视野的创新型农业人才奠定基础。