关键词:
气单胞菌
噬菌体
生物学特性
全基因组
摘要:
目的:分离气单胞菌噬菌体并研究其特性,为气单胞菌的噬菌体防治提供理论基础。方法:以嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)A050为宿主菌筛选噬菌体,利用双层平板法研究噬菌体一步生长曲线、最佳感染复数和稳定性等生物学特征;通过电镜观察噬菌体形态;利用Illumina Hiseq平台进行噬菌体基因组测序,利用在线工具Blastn、CGView、VipTree、VIRIDIC和Mauve软件进行生信分析。结果:分离得到一株新种噬菌体phiA050,其噬菌斑透明、无晕圈,直径为(0.10±0.02)cm;电镜观察显示,phiA050头部为正廿面体,直径为(70.8±2.7)nm,尾长为(71.3±3.7)nm;宿主谱检测结果显示,phiA050可裂解68株气单胞菌中的19株;phiA050对宿主气单胞菌A050的最佳感染复数为0.001,一步生长曲线显示其潜伏期为30 min,裂解量为158 PFU/cell;phiA050耐受的pH范围在4~10之间,耐受温度可达50℃(1 h),60℃时只有少量存活;phiA050基因组全长53322 bp,GC含量为44.75%,注释出61个开放阅读框(open reading frame,ORFs);Blastn序列比对发现,phiA050与最近源的欧文氏菌噬菌体Faunus总相似度仅为36.30%,根据国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)最新的病毒分类标准,噬菌体phiA050应归于新属新种。结论:分离得到一株新种噬菌体phiA050,该噬菌体与现有数据库中噬菌体相似性低,具有独特的研究价值和应用前景。