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暂养期健康海带和患病海带附生菌群落结构及多样性分析

Community structure and diversity of epiphytic bacteria in healthy and diseased Saccharina japonica seedlings during a temporary rearing period

作     者:冯磊 钟晨辉 林琪 唐隆晨 FENG Lei;ZHONG Chenhui;LIN Qi;TANG Longchen

作者机构:上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 福建省水产研究所福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室福建厦门361000 

出 版 物:《中国水产科学》 (Journal of Fishery Sciences of China)

年 卷 期:2021年第28卷第4期

页      面:460-469页

核心收录:

学科分类:090801[农学-水产养殖] 0908[农学-水产] 09[农学] 

基  金:农业农村部现代农业产业技术体系建设专项(CARS-50) 福建省水产种业创新与产业化工程项目(2017FJSCZY01) 福建省科技重大专项(2019NZ08003) 

主  题:海带 暂养期 附生菌 多样性 群落结构 

摘      要:为探究暂养期健康海带(Saccharina japonica)和患病海带附生菌群落结构差异及其与海水之间的关系,本研究采用高通量测序技术,分析了暂养期健康海带(HS)、患病海带(DS)、健康海带养殖区海水(HW)和患病海带养殖区海水(DW) 4个样本中微生物的16S rRNA序列。结果显示,共识别出32个门, 77个纲, 398个科, 797个属, 1772个OTUs。从门分类上来说,海带样本的优势细菌门为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes),其中拟杆菌门、放线菌门和厚壁菌门在HS和DS样本中的相对丰度分别为19.91%、10.79%、15.52%和37.31%、1.65%、5.92%,差异较大;从科分类上来说,黄杆菌科(Flavobacteriaceae)和红杆菌科(Rhodobacteraceae)在HS样本中的相对丰度分别为10.7%和12.55%,均低于DS样本(33.47%和21.17%)。多样性分析显示, HS与DS样本之间的Ace和Chao指数无显著性差异(P0.05), Shannon和Simpson指数具有显著性差异(P0.05)。SIMPER分析显示,患病海带中3个细菌科的4个OTUs (OTU1169、OTU1111、OTU1351和OTU1353)共提供35.88%的差异率。综上所述,健康海带和患病海带优势附生菌的相对丰度具有较大差异,种间分布具有显著性差异(P0.05),但物种丰富度无显著性差异,属于黄杆菌科的OTU1169和OTU1111是诊断海带是否感染疾病的主要指示菌。本研究从群落结构和多样性的角度分析附生菌与暂养期海带病害的互作关系,为今后揭示暂养期海带病害发生的机制提供科学参考。

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