基于R语言子宫内膜癌脂代谢基因差异性分析及免疫组织化学验证

作     者：刘桐宇 胡丹 李杰萍 朱伟峰 许春伟 谢榕 杨琳 邹建平 嵇海舟 孙阳 LIU Tongyu;HU Dan;LI Jieping;ZHU Weifeng;XU Chunwei;XIE Rong;YANG Lin;ZOU Jianping;JI Haizhou;SUN Yang

作者机构：福建医科大学附属福建省肿瘤医院妇科福州350014 福建医科大学附属福建省肿瘤医院病理科福州350014 武警福建总队医院检验科福州350003 

出 版 物：《临床与病理杂志》 (Journal of Clinical and Pathological Research)

年 卷 期：2021年第41卷第4期

页      面：832-839页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：福建省卫生和计划生育委员会医学创新课题(2017-CX-9) 福建省科技计划项目(2018Y2003) 

主　　题：R语言 脂质代谢 内膜癌 免疫组织化学 

摘      要：目的:探讨R语言在基因表达数据库中筛选子宫内膜癌相关的脂质代谢关键分子的可行性。方法:从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中筛选子宫内膜癌测序集GSE56087,基于R语言进行基因差异性分析及信号通路分析,从结果中选取可能有意义的高表达基因并进行免疫组织化学验证。结果:通过基因差异性分析、富集分析并结合信号通路分析,筛选出子宫内膜癌组织中代谢相关基因CYP3A4与NR1I2高表达。临床标本免疫组织化学显示CYP3A4与NR1I2在癌与癌旁组织的表达差异有统计学意义(P0.05)。结论:R语言对已有基因表达数据库进行基因差异性分析和信号通路分析是可行的。对GSE56087测序结果进行差异性基因分析发现,脂质代谢相关的CPY基因家族、NR基因家族有高表达,尤其CYP3A4与NR1I2,值得后续深入研究。