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芒果细菌性角斑病菌内切葡聚糖酶基因的克隆与表达分析

Cloning and Expression Analysis of Endo-1,4-β-D-glucanase Gene of Xanthomonas citri ***

作     者:姚全胜 杨倩 柳凤 詹儒林 YAO Quansheng;YANG Qian;LIU Feng;ZHAN Rulin

作者机构:中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/海南省热带园艺产品采后生理与保鲜重点实验室广东湛江524091 

出 版 物:《热带作物学报》 (Chinese Journal of Tropical Crops)

年 卷 期:2021年第42卷第4期

页      面:1061-1065页

核心收录:

学科分类:09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治] 

基  金:国家重点研发计划项目(No.2019YFD1001100) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(No.1630062020014) 

主  题:芒果 细菌性角斑病 内切葡聚糖酶 克隆 序列分析 

摘      要:由柑橘黄单胞菌芒果致病变种(Xanthomonas citri ***,Xcm)引起的芒果细菌性角斑病是芒果上的一种重要的细菌性病害。利用同源基因克隆技术克隆了Xcm上内切葡聚糖酶(endoglucanase)基因CEL的全长,经测序后运用多种生物信息学软件对其序列进行分析。结果表明:CEL基因的完整阅读框包含1134 bp,编码377个氨基酸;预测分子量为40.72 kDa;等电点为9.01;不稳定指数39.93,为稳定蛋白;亲水性为–0.081,有信号肽;总磷酸化位点有51个,无跨膜螺旋;在二级结构预测中,α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸结构分别为35.28%、6.10%、16.45%和42.18%。经保守结构域预测,具有Cellulase保守结构域。系统进化树结果显示,该基因的氨基酸序列与*** *** *** 859(CCF67690.1)的亲缘关系最近。以gyrB、GAPHD和rpoD作为内参基因,经qRT-PCR分析CEL在Xcm侵染芒果叶片12h后表达量持续上升,明显高于对照,在72h处为最大表达量,由此推断该基因在病菌侵染时发挥重要作用。

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