基于mtDNA Cytb基因的马可·波罗盘羊遗传多样性与起源进化分析

作     者：肖逸 王孟文 张秀英 古丽扎尔·阿不都克力木 韩建林 王玉涛 XIAO Yi;WANG Mengwen;ZHANG Xiuying;GULZAR Abdukerim;HAN Jianlin;WANG Yutao

作者机构：喀什大学生命与地理科学学院新疆帕米尔高原生物资源与生态重点实验室喀什844000 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2021年第48卷第5期

页      面：1681-1690页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：中国科学院“西部之光”项目(2018-XBQNXZ-A1-002) 喀什大学创新团队建设项目((17)2602) 

主　　题：马可·波罗盘羊 mtDNA Cytb基因 遗传多样性 系统进化 

摘      要：为进一步明确马可·波罗盘羊(Ovis ammon polii)与家养绵羊的遗传进化关系,本试验提取20只马可·波罗盘羊的基因组DNA,并对其线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cytb)基因进行PCR扩增,下载GenBank中野生绵羊和家养绵羊的mtDNA Cytb基因序列,利用邻接法(Neighbor-Joining,NJ)构建系统发育树,以阐明野生绵羊和家养绵羊遗传多样水平与起源进化关系。结果显示,马可·波罗盘羊mtDNA Cytb基因全长1140 bp,富含A、T碱基,含量为58.3%,存在10个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)为0.884;存在122个SNPs位点,占核苷酸总数的2.35%,其中单一多态位点2个,简约信息位点120个,均为两碱基突变,转换发生的频率远远高于颠换;平均核苷酸多样性(pi)为0.02090;平均核苷酸差异性(K)为23.826,表明马可·波罗盘羊mtDNA Cytb区单倍型和核苷酸遗传多样性丰富。系统发育分析显示,野生绵羊分为明显的三支,其中马可·波罗盘羊单独形成一支,且与盘羊西藏亚种遗传距离最近,与天山盘羊、蒙古盘羊遗传距离最远,而家养绵羊与摩弗仑羊亲缘关系较近,与盘羊亲缘关系较远。以上结果表明盘羊对家养绵羊起源进化贡献较低,支持摩弗仑羊可能是家养绵羊野生祖先的观点。