安徽某淡水龙虾养殖群体分类的分子标记筛选

作     者：樊慧敏 彭开松 邹文腾 鲁义善 程起群 FAN Hui-Min;PENG Kai-Song;ZOU Wen-Teng;LU Yi-Shan;CHENG Qi-Qun

作者机构：水产养殖健康与公共卫生实验室安徽农业大学动物科技学院合肥230036 广东省水生动物健康评估工程技术研究中心广东海洋大学深圳研究院深圳518120 农业部东海与海洋渔业资源开发利用重点实验室中国水产科学研究院东海水产研究所上海200090 

出 版 物：《动物学杂志》 (Chinese Journal of Zoology)

年 卷 期：2021年第56卷第3期

页      面：441-448页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：安徽省现代农业产业技术体系项目(皖农科84号) 安徽省重点研究与开发计划项目(No.1704g07020123) 广东省现代农业产业体系专项资金(No.2019KJ141) 

主　　题：线粒体基因 淡水龙虾 四脊滑螯虾 分类 分子标记 

摘      要：为筛选可用于淡水龙虾养殖群体物种分类的分子标记,对安徽省某水产养殖有限公司采集的淡水龙虾样本进行了线粒体COⅠ、16S rDNA、D-loop、Cyt b及12S rDNA基因的测序分析,并与GenBank中30个滑螯虾属(Cherax)物种的相应基因序列比对,同时,进行上述5种分子标记在种内个体间、属内种间、科内属间和目内科间的同源性变异范围比对分析。结果显示,本研究所采集淡水龙虾样本与四脊滑螯虾(C. quadricarinatus)的相似性最高,其中,1 113 bp的Cyt b相似性100%,COⅠ、16S r DNA及12S rDNA相似性都在99%以上;在以克氏原螯虾(Procambarus clarkii)为外类群构建的邻接系统发育树中,本研究样本与四脊滑螯虾聚为一支,然后与其他物种聚合构成系统树,确定本研究采集的淡水龙虾样本为四脊滑螯虾;通过同源性变异范围比对分析,在淡水龙虾养殖群体的分子分类工作中,16S rDNA、Cyt b及12S rDNA比COⅠ和D-loop这2种分子标记具有较强优势。本研究结果可为今后淡水龙虾养殖场中物种的分类鉴定工作提供参考。