大鼠骨髓基质细胞分化为施万细胞样细胞过程中的基因表达变化

作     者：陈娇 张丹丹 李军平 牛建国 何仲义 贾桦 Chen Jiao;Zhang Dandan;Li Junping;Niu Jianguo;He Zhongyi;Jia Hua

作者机构：宁夏医科大学基础医学院人体解剖与组织胚胎学系银川750004 承德医学院病理生理学教研室承德067000 

出 版 物：《神经解剖学杂志》 (Chinese Journal of Neuroanatomy)

年 卷 期：2021年第37卷第3期

页      面：315-322页

核心收录：

学科分类：10[医学] 

基　　金：宁夏自然科学基金(2021AAC03150) 

主　　题：骨髓基质细胞 施万细胞样细胞 分化 转录组测序 大鼠 

摘      要：目的:利用转录组测序技术(RNA-seq)检测骨髓基质细胞(BMSCs)分化为施万细胞(SCs)样细胞过程中基因表达谱的变化,筛选与分化相关的差异表达基因,并分析与分化相关的信号通路。方法:体外培养大鼠BMSCs,用三步诱导法对其进行诱导,在复合生长因子诱导第12 h和7 d收集样本。经Illumina测序平台对BMSCs、诱导培养基(DM)诱导12 h(DM-12 h)和7 d(DM-7 d)的细胞进行生物信息分析,采用Cluster Profiler软件对差异基因集进行GO功能和KEGG代谢通路富集分析。结果:与BMSCs组相比,DM-12 h组有578个基因表达上调,632个基因表达下调;与DM-12 h组相比,DM-7 d组有1165个基因表达上调,872个基因表达下调;与BMSCs组相比,DM-7 d组有629个基因表达上调,529个基因表达下调。经Venn分析,共筛选出140个在各阶段共同表达的差异基因,其中与分化相关的基因主要富集在细胞周期、DNA复制和p53信号通路;并确定Ccne2、Mcm3和Rrm2可作为下一步研究的候选基因。结论:本研究首次基于转录组测序构建BMSCs诱导分化为SCs样细胞的基因表达谱,揭示分化过程中的差异基因,并筛选出Ccne2、Mcm3和Rrm2作为研究目的基因,为阐明BMSCs分化为SCs样细胞的机制提供依据。