右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B)34991的全基因组分析

作     者：王珊珊 石继春 杜宗利 石刚 龙新星 叶强 徐颖华 WANG Shan-shan;SHI Ji-chun;DU Zong-li;SHI Gang;LONG Xin-xing;YE Qiang;XU Ying-hua

作者机构：中国食品药品检定研究院卫生部生物技术产品检定方法及其标准化重点实验室北京102629 

出 版 物：《中国生物制品学杂志》 (Chinese Journal of Biologicals)

年 卷 期：2021年第34卷第6期

页      面：666-670,677页

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：国家重点研发计划项目(2018YFC1603900) 医学微生物资源子平台运行与服务(NIMR-2019) 

主　　题：右旋糖酐 肠膜状明串珠菌 生产用菌种 全基因组序列 质量控制 

摘      要：目的对我国右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B)34991的全基因组分子特征进行分析。方法将CMCC(B)34991菌种培养后,依次进行形态观察、生化鉴定、质谱分析及16S rRNA序列测定,同时应用高通量测序技术,对CMCC(B)34991菌种进行全基因组序列测定和比较基因组学分析。结果CMCC(B)34991菌种与4种肠膜状明串珠菌亚种代表株的16S rRNA基因序列相似度均大于99.5%。CMCC(B)34991菌种染色体全基因组序列全长为1857684 bp,平均GC含量为38.2%,共含有2089个基因,编码基因占整个基因组序列的88.4%,其中具有直系同源簇(clusters of orthologous groups,COG)功能1621个,参与KEGG代谢通路1112个。CMCC(B)34991菌种与4种肠膜状明串珠菌亚种代表株之间核苷酸同源性很高,平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)值大于98.5%,DNA-DNA杂交(DDH)值超过89%,它们之间的共有基因1186个,而CMCC(B)34991菌种基因组特有基因247个。进化树显示,肠膜状明串珠菌与其他明串珠菌的分子进化历程不同。结论首次获得了我国右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B)34991全基因组的基本特征,为后续右旋糖酐的生产工艺优化和生产用菌种的质量控制奠定了基础。