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火炬松HMGR基因的系统发育、分子进化和表达分析

Phylogenetic,molecular evolution and expression analyses of HMGR gene in loblolly pine

作     者:毛积鹏 杜澄举 黄林旺 刘天颐 黄少伟 MAO Jipeng;DU Chengju;HUANG Linwang;LIU Tianyi;HUANG Shaowei

作者机构:华南农业大学林学与风景园林学院广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广州510642 台山市红岭种子园台山529223 

出 版 物:《生物学杂志》 (Journal of Biology)

年 卷 期:2021年第38卷第3期

页      面:68-72页

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基  金:国家林业局948项目(2014-4-72) “十三五”重点研发子课题项目(2017YFD0600502-3) 

主  题:火炬松 HMGR基因 分子进化 表达量 

摘      要:3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)是植物萜类化合物甲羟戊酸(MVA)生物合成途径的关键酶。为了解其编码基因HMGR的系统发育及其在火炬松进化枝中的分子进化和表达特性。选取19个代表性物种的HMGR基因序列用于系统发育和分子进化分析,并以火炬松5个不同的组织部位为材料分析HMGR基因的表达特性。结果发现:HMGR基因在进化过程中相对保守,序列间的平均遗传距离为0.323,受到的平均选择压大小为0.1212,表明HMGR基因在进化过程主要受纯化选择作用;在火炬松进化枝中受到的选择压大小为0.4293,并有14个位点检测到正向选择作用,且后验概率值大于0.95,表明HMGR基因不同位点受到的选择压差异显著;HMGR基因在火炬松嫩叶中具有最高的表达量,表明HMGR基因的表达具有一定的组织特异性。

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