沙棘根瘤内生菌株库构建与微生物多样性分析

作     者：魏继华 李佳益 刘宏 张建国 罗红梅 何彩云 WEI Jihua;LI Jiayi;LIU Hong;ZHANG Jianguo;LUO Hongmei;HE Caiyun

作者机构：中国林业科学研究院林业研究所国家林业和草原局林木培育重点实验室北京100091 南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 中国林业科学研究院沙漠林业实验中心内蒙古磴口015200 

出 版 物：《浙江农林大学学报》 (Journal of Zhejiang A&F University)

年 卷 期：2022年第39卷第2期

页      面：356-363页

核心收录：

学科分类：07[理学] 0713[理学-生态学] 

基　　金：中国林业科学研究院林业研究所林木培育重点实验室专项(ZDRIF2019) 

主　　题：根瘤内生菌 微生物多样性 16S rDNA高通量测序 菌株库构建 沙棘 

摘      要：【目的】沙棘Hippophae rhamnoides根瘤中拥有丰富的微生物资源,探究根瘤内生菌微生物多样性,比较高通量测序与纯培养方法的优劣。【方法】运用16S rRNA高通量测序技术探究沙棘根瘤内生菌相对丰度和多样性差异,并对根瘤内生菌进行分离纯培养,以完成内生菌株库初步构建。【结果】(1)传统分离方法得到纯培养菌株96株,共4门8纲8目13科19属。在门分类水平上,相对丰度较高的主要为变形菌门Proteobacteria和厚壁菌门Firmicutes。(2)高通量测序分析6组样品(M1~M6)中共有14门34纲89目148科314属。在门分类水平上,相对丰度较高的主要为放线菌门Actinobacteria和变形菌门,两者相对丰度之和为87.50%~97.10%。在属的分类水平上,弗兰克氏菌属Frankia占绝对优势,相对丰度为20.12%~74.81%,平均相对丰度为51.49%。(3)高通量测序与纯培养方法的结果有明显差异,在科和属的分类单元上差异较大。【结论】2种方法都体现沙棘根瘤内生菌的多样性,但纯培养方法仅能够分离到部分内生菌,难以评估物种组成及相对丰度。高通量测序分析能够更为全面地反映多样性信息,且为优化纯培养条件而分离特定物种奠定基础。