志贺菌CRISPR的检测及其与耐药的关系

作     者：王琳琳 王颖芳 段广才 薛泽润 郭向娇 王鹏飞 郗园林 杨海燕 

作者机构：郑州大学公共卫生学院流行病教研室河南郑州450001 河南科技大学预防医学教研室河南洛阳471003 新乡医学院分子诊断与医学检验技术河南省协同创新中心河南新乡453003 

出 版 物：《微生物学报》 (Acta Microbiologica Sinica)

年 卷 期：2015年第55卷第4期

页      面：476-483页

核心收录：

学科分类：1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 10[医学] 

基　　金：国家科技重大专项(2013ZX10004607) 

主　　题：志贺菌 多重耐药 CRISPR 

摘      要：【目的】检测志贺菌成簇规律间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR),并分析其与志贺菌耐药的关系。【方法】根据CRISPR DB数据库公布的志贺菌确定的CRISPR结构序列CRISPR-S2、CRISPR-S4和可能的CRISPR结构序列CRISPR-S1、CRISPR-S3设计四对引物,对60株志贺菌进行PCR扩增。采用CRISPR Finder分析CRISPR,采用改良K-B药敏纸片法检测志贺菌耐药情况,并分析CRISPR-S4与耐药的关系。【结果】确定的CRISPR结构的总阳性率为95%,四个CRISPR位点组成12种CRISPR谱型(A-L),除K型外均含确定的CRISPR结构,新发现1种重复序列和12种间隔序列。60株志贺菌的多重耐药率为53.33%。CRISPR-S4阳性菌株与阴性菌株之间,耐药的分布差异无统计学意义,但多重耐药菌株和耐TE菌株CRISPR-S4的重复序列多为R4.1,其3 末端缺失碱基AC;多重耐药菌株CRISPR-S4的间隔序列多为Sp5.1、Sp6.1和Sp7。【结论】CRISPR在志贺菌中广泛分布。CRISPR重复序列的变异和间隔序列的多样性可能与志贺菌耐药有关。