利用SSR分子标记分析云南陆稻品种遗传多样性

作     者：徐建欣 王云月 姚春 刘云霞 汤淼 陆明兴 XU Jian-xin;WANG Yun-yue;YAO Chun;LIU Yun-xia;TANG Miao;LU Ming-xing

作者机构：云南农业大学农业生物多样性与植物病害控制教育部重点实验室云南昆明650201 

出 版 物：《中国水稻科学》 (Chinese Journal of Rice Science)

年 卷 期：2012年第26卷第2期

页      面：155-164页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家973计划资助项目(2006CB100205) 云南省水稻产业技术体系资助项目(A3006517) 

主　　题：陆稻 遗传多样性 简单重复序列 主坐标分析 

摘      要：利用24对SSR引物对云南131个陆稻品种进行遗传多样性分析。共检测到195个等位基因。每个位点的等位基因数平均为8.125个,范围在5(RM55)～13(RM218、RM241)之间;平均表观杂合度为0.0014,平均期望杂合度为0.6545;平均Shannon-Weaver指数(I)为1.381;Nei基因多样性指数(H)平均为0.6543,变幅为0.2073(RM235)～0.8689(RM218)。不同地区间陆稻种质资源遗传多样性比较分析表明,滇西南和滇南地区存在丰富的遗传变异,是云南陆稻品种遗传多样性的分布中心。藏缅语族和孟-高棉语族所种植的陆稻品种遗传多样性最丰富。AMOVA分析表明陆稻的遗传变异主要存在于地区内品种间(82%),只有3%遗传变异存在于地区间,品种内的遗传变异占15%。聚类分析显示Nei遗传相似系数为0.22时,云南陆稻品种分为籼粳两个类群,主坐标分析与UPGMA聚类结果基本吻合,并将类群Ⅳ的4个偏籼品种从粳稻类群中重新划归到籼稻类群中,校正了UPGMA聚类的误差,但是不能区分地理组。