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黄淮产区地黄种质遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建

Genetic Diversity Analysis and SSR Fingerprint Construction of Germplasms of Rehmannia glutinosa in Huang-Huai Region

作     者:李春鑫 张永战 陈国参 杨铁钢 张英涛 李春 董诚明 LI Chunxin;ZHANG Yongzhan;CHEN Guocan;YANG Tiegang;ZHANG Yingtao;LI Chun;DONG Chengming

作者机构:河南省科学院生物研究所有限责任公司河南郑州450008 河南省农业科学院经济作物研究所河南郑州450002 河南省农业科学院芝麻研究中心河南郑州450002 河南中医药大学药学院河南郑州450046 

出 版 物:《河南农业科学》 (Journal of Henan Agricultural Sciences)

年 卷 期:2022年第51卷第7期

页      面:61-74页

学科分类:1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 0713[理学-生态学] 10[医学] 

基  金:河南省科学院科研开发专项(210205027) 

主  题:地黄 种质 多态性引物 遗传多样性分析 SSR指纹图谱 黄淮产区 

摘      要:为明确我国黄淮产区地黄种质间遗传多样性,解析种质间的亲缘关系,为该区地黄品种选育和种质鉴定提供依据,利用毛细管电泳技术和108对SSR引物对地黄种质进行分析,以获取种质间遗传相似系数、多态性引物、种质分辨率,利用软件TASSEL 3.0和Fig Tree(V 1.4.3)进行聚类分析和作图,选取多态性好、稳定性强的引物构建地黄种质的SSR指纹图谱。结果表明,共获得多态性引物50对,其片段长度在107~365 bp,种质间遗传相似系数在0.552~0.984,平均为0.729,野生种质的平均遗传相似系数明显低于地方品种和当前主栽品种。聚类结果显示,17个地黄种质分为3个亚群。选取并利用多态性强和分辨率高、扩增稳定的15对引物构建了地黄种质的SSR指纹图谱,实现了对每个地黄种质的快速鉴定。综上,SSR分析是实现地黄鉴真、聚类、DNA指纹图谱构建的一种有效方法。

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