薄壳山核桃(Carya illinoinensis)叶绿体基因组及其特征分析

作     者：蒋思思 袁军 周文君 钮根花 周俊琴 JIANG Sisi;YUAN Jun;ZHOU Wenjun;NIU Genhua;ZHOU Junqin

作者机构：中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室长沙410004 德州农工大学农业生命研究中心德克萨斯州达拉斯75252美国 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2022年第49卷第8期

页      面：1772-1784页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：湖南省重点研发项目(2018WK2041) 

主　　题：山核桃 叶绿体基因组 简单重复序列 系统发育关系 

摘      要：利用Illumina平台对薄壳山核桃(Caryaillinoinensis)品种‘金华’‘波尼’和1株实生古树单株的叶绿体全基因组进行测序,并对其特征进行分析。3个薄壳山核桃叶绿体基因组均呈典型的四分体结构,大小分别为160819、162611和160762 bp,基因序列高度保守。三者均注释得到124个基因,包括79种蛋白编码基因、38个tRNA和7个r RNA基因;三者有相似的重复序列类型,在其叶绿体基因组序列中分别检测出74、74和73个SSR位点;系统发育分析表明,三者均与喙核桃(Annamocarya sinensis)亲缘关系最为密切。