水曲柳FmPDK1基因克隆及表达模式分析

作     者：刘璋 赵兴堂 于磊 詹亚光 张旭 Liu Zhang;Zhao Xingtang;Yu Lei;Zhan Yaguang;Zhang Xu

作者机构：东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2022年第20卷第16期

页      面：5221-5228页

学科分类：0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基　　金：黑龙江省应用技术研究与开发项目(GA19B201)资助 

主　　题：水曲柳 PDK1蛋白激酶 基因克隆 生物信息分析 表达模式分析 

摘      要：3-磷酸肌苷依赖性蛋白激酶1(PDK1)是一种高度保守的真核细胞激酶,是许多AGC激酶亚家族成员的核心调控因子。通过其对AGC激酶的调控进而控制许多基本细胞过程。本研究克隆获得了水曲柳PDK1的基因序列全长,将其命名为Fm PDK1(已上传至NCBI基因库,NCBI序列号:MG356659)。水曲柳Fm PDK1全长1470 bp,编码481个氨基酸;该基因内部有完整的open reading frame(ORF),存在螺旋-环-螺旋结构;亲水性不稳定蛋白;不存在信号肽,具有跨膜能力;亚细胞定位预测该蛋白最可能定位于细胞核内;水曲柳Fm PDK1与芝麻(Sesamum indicum XP_011094484.1)亲缘关系最近,同源性为83.9%;4℃低温处理下,Fm PDK1的表达量发生显著变化;100 mmol/L NaCl处理下,Fm PDK1的表达量也发生了变化但是并不显著,脱落酸(ABA)和赤霉素(GA)以及IAA(生长素)三种激素诱导下,Fm PDK1表达量均变化显著。水曲柳Fm PDK1对寒冷、盐等非生物胁迫以及激素信号做出了应答,有望为进一步研究水曲柳AGC激酶亚家族成员中PDK1基因的特性及功能提供科学依据。