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CRISPR单管等温扩增技术高灵敏检测核酸:以检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)RNA为例

Integrating CRISPR and isothermal amplification reactions in single-tubes for ultrasensitive detection of nucleic acids:the SARS-CoV-2 RNA example

作     者:冯薇 肖航 袁爱姣 邓兆佳 王小燕 彭汉勇 乐晓春 Wei Feng;Hang Xiao;Aijiao Yuan;Zhaojia Deng;Xiaoyan Wang;Hanyong Peng;X.Chris Le

作者机构:中国科学院生态环境研究中心环境化学与生态毒理学国家重点实验室北京100085 阿尔伯塔大学医学院病理和实验医学系分析和环境毒理研究所阿尔伯塔T6G2G3加拿大 

出 版 物:《中国科学:化学》 (SCIENTIA SINICA Chimica)

年 卷 期:2022年第52卷第9期

页      面:1685-1698页

核心收录:

学科分类:100208[医学-临床检验诊断学] 1002[医学-临床医学] 10[医学] 

基  金:国家自然优秀青年科学基金(海外) 中国科学院生态环境研究中心环境化学与生态毒理学国家重点实验室的资助项目 

主  题:CRISPR 分子诊断 SARS-CoV-2 等温扩增 酶反应动力学 即时检测 核酸 

摘      要:簇状规则间隔短回文重复序列(CRISPR)及其相关蛋白(Cas)系统在分子检测领域正在快速发展,在核酸识别上已展现出高特异性、可编程性和多系统兼容性,成为一种极具潜力的分子诊断工具.单独CRISPR-Cas系统检测RNA的灵敏度受到其反式切割动力学限制,因此需要与等温核酸扩增技术联用.将两个体系整合在单管中反应有两种策略:(1)将等温扩增与CRISPR-Cas体系分隔在管内不同位置进行分步反应;(2)在均相混合液中完成核酸扩增与检测.单管检测的关键是对多个反应的兼容性进行研究,从而最大限度地提升两种体系在同一条件下的性能,最后实现超高灵敏、快速、便捷地检测核酸.本文聚焦于基于CRISPR的单管超灵敏SARS-CoV-2 RNA检测技术,从方法开发的原理、性能和挑战等多个方面综述了近期的研究进展和发展方向,并指出理解CRISPR-Cas系统的反式切割动力学的重要性.

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