多杀性巴氏杆菌攻毒小鼠肺脏的转录组分析

作     者：陈杰 陈巧玲 陈思 程逸文 刘志勇 李彬 刘昂 满初日嘎 王凤阳 杜丽 李昌 金宁一 Chen Jie;Chen Qiaoling;Chen Si;Cheng Yiwen;Liu Zhiyong;Li Bin;Liu Ang;Riga Mangchu;Wang Fengyang;Du Li;Li Chang;Jin Ningyi

作者机构：海南大学动物科技学院海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室海口570228 军事医学科学院军事兽医研究所长春130122 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2022年第41卷第4期

页      面：778-788页

核心收录：

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：国家现代农业产业技术体系资助项目(财政部和农业农村部-CARS38) 海南省院士团队创新中心项目和海南省院士创新平台科研专项(YSPTZX202013)共同资助 

主　　题：多杀性巴氏杆菌 小鼠肺脏 转录组 实时荧光定量PCR 

摘      要：多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida)可感染多种动物宿主并引发败血症和呼吸道疾病,危害动物健康,给养殖业带来严重经济损失。本研究为探究多杀性巴氏杆菌感染期间对宿主肺脏基因表达的影响,选取羊源A型多杀性巴氏杆菌对小鼠(Mus musculus)进行攻毒实验,攻毒后72 h采集小鼠肺脏组织并提取总RNA。基于转录组测序,与对照组相比,攻毒组获得2443个差异表达基因,其中有1437个基因上调,1006个基因下调。对2443个差异表达基因进行GO富集分析,结果显示,差异基因显著富集的GO terms主要有B细胞稳态、T细胞迁移的正调控、整合素复合物和胶原蛋白结合;KEGG富集分析结果显示,差异基因显著富集于11条免疫炎症信号通路,包括细胞因子与细胞因子受体互作、趋化因子信号通路等;免疫炎症相关信号通路中,差异基因经蛋白质-蛋白质互作分析,结果显示,C3、C3ar1、C5ar1、Cxcl10、Cxcr2和Gng11基因处于网络中心,说明这些基因在多杀性巴氏杆菌感染过程中发挥了重要作用;从11条免疫炎症通路的基因中挑选10个进行实时荧光定量PCR验证,发现有8个基因表达趋势与测序结果相符,说明测序数据可靠。本研究展示了小鼠在多杀性巴氏杆菌感染过程中参与免疫反应的关键基因,为探索宿主抗多杀性巴氏杆菌感染分子机制提供了理论依据。