泛癌中SMYD3的表达与预后及免疫浸润之间的关系

作     者：陈浩然 司甜 姜懿珅 王殿恒 周雅博 吕家迪 CHEN Haoran;SI Tian;JIANG Yishen;WANG Dianheng;ZHOU Yabo;LYU Jiadi

作者机构：中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院、免疫学系、医学分子生物学国家重点实验室北京100005 

出 版 物：《基础医学与临床》 (Basic and Clinical Medicine)

年 卷 期：2023年第43卷第1期

页      面：68-75页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(82003145) 

主　　题：SMYD3 泛癌分析 免疫浸润 免疫逃逸 MHC-Ⅰ类分子 

摘      要：目的研究SMYD3表达在泛癌中的预后价值,分析SMYD3对于肿瘤组织免疫浸润的影响。方法从TCGA、GTEx、HPA等数据库收集基因表达矩阵以及蛋白质表达等数据。使用Kaplan-Meier算法评价了SMYD3在不同肿瘤中的预后价值。使用ESTIMATE算法和Timer数据库的信息分析SMYD3与免疫浸润的关系。以小鼠黑色素瘤细胞系B16为例,在细胞水平验证SMYD3对抗原提呈基因表达的影响。结果转录组和蛋白组学数据表明SMYD3在肿瘤组织中表达升高,并且SMYD3的高表达和泛癌的不良预后相关(P0.05);SMYD3抑制了多种免疫细胞的浸润(P0.05),敲除Smyd3的B16细胞抗原呈递基因表达水平升高(P0.05)。结论Smyd3是一个重要的肿瘤预后相关基因,其通过下调抗原递呈基因的表达,抑制免疫细胞浸润,诱导肿瘤细胞免疫逃逸。