大黄鱼slitrk3基因启动子克隆及转录调控分析

作     者：周锐涛 岳珠峰 纪焦军 温靖 姜丹 王志勇 方铭 ZHOU Ruitao;YUE Zhufeng;JI Jiaojun;WEN Jing;JIANG Dan;WANG Zhiyong;FANG Ming

作者机构：集美大学水产学院/农业农村部东海海水健康养殖重点实验室福建厦门361021 

出 版 物：《南方水产科学》 (South China Fisheries Science)

年 卷 期：2023年第19卷第4期

页      面：68-76页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家重点研发计划项目(2018YFD0901201) 

主　　题：大黄鱼 slitrk3基因 启动子 转录调控 

摘      要：神经突触相关蛋白Slitrk3具有调节抑制性突触发育的作用。研究大黄鱼(Larimichthys crocea)神经突触黏附分子slitrk3基因的转录调控机制,可为解决大黄鱼养殖面临的生长、应激及抗逆等问题提供新思路。通过生物信息学方法对大黄鱼及其他物种的Slitrk3氨基酸进行多重序列比对和系统进化树分析,并预测大黄鱼slitrk3基因启动子区域相关的调控元件,采用双荧光素酶报告基因系统检测大黄鱼slitrk3基因启动子区域的转录活性。生物信息学分析结果显示,Slitrk3氨基酸序列在鱼类中具有较高的保守性;大黄鱼slitrk3基因启动子区域预测存在2个潜在的转录起始位点、2个CpG岛以及Sp1、GR、C/EBPα和C/EBPβ等多种转录因子结合位点。双荧光素酶报告基因系统结果显示,大黄鱼slitrk3基因启动子区域的−1970—−1614 bp、−1210—−667 bp存在正调控元件,−1614—−1210 bp、−667—−376 bp、−376—−147 bp存在负调控元件,推测−147—+16 bp为核心启动子。