中国百日咳疫苗生产用菌株完成图基因组遗传分析

作     者：李喆 吴燕 王丽婵 卫辰 廖平安 朱德武 瞿明霞 马霄 LI Zhe;WU Yan;WANG Lichan;WEI Chen;LIAO Pingan;ZHU Dewu;QU Mingxia;MA Xiao

作者机构：中国食品药品检定研究院卫生部生物技术产品检定方法及其标准化重点实验室北京102629 武汉生物制品研究所有限责任公司湖北武汉430027 

出 版 物：《中国生物制品学杂志》 (Chinese Journal of Biologicals)

年 卷 期：2023年第36卷第12期

页      面：1419-1424,1429页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：国家自然科学基金(82172312) 

主　　题：百日咳疫苗 原始菌株 完成图基因组 遗传稳定性 质量控制 

摘      要：目的对我国百日咳疫苗生产用菌株进行完成图基因组的遗传分析。方法利用PacBio Sequel三代测序平台与Illumina二代测序平台相结合的方式,对百日咳疫苗生产用原始菌株进行完成图基因组测序,并进行基因组组分分析、基因功能注释以及比较基因组分析。同时对企业生产过程中不同代次菌株进行遗传稳定性分析。结果获得了百日咳疫苗原始菌株及其生产过程不同代次菌株的完成图基因组,基因组长度4.1 Mb,GC含量68%,不同代次间基因组结构稳定;获得并分析了pt、pha、prn、fim2、fim3、act、tct、ompA、BrKA、rplD、BP1569等具有免疫原性或潜在免疫原性的基因,不同代次间基因未发生变异。结论本研究获得了结构完整、背景清晰的百日咳疫苗生产用菌株完成图基因组,为我国百日咳疫苗生产用菌种的质量控制提供了依据,同时也为百日咳分子流行病学的研究提供了参考。