湿加松TIFY基因家族的鉴定、分类与分析

作     者：叶佩琪 林晓慧 龙永彬 刘天颐 王哲 YE Peiqi;LIN Xiaohui;LONG Yongbin;LIU Tianyi;WANG Zhe

作者机构：华南农业大学林学与风景园林学院广东广州510642 广东省森林培育与保护利用重点实验室/广东省林业科学研究院广东广州510520 

出 版 物：《林业与环境科学》 (Forestry and Environmental Science)

年 卷 期：2024年第40卷第2期

页      面：1-10页

学科分类：0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基　　金：广东省基础与应用基础研究基金(2021A1515011098) 

主　　题：湿加松 TIFY转录因子 生物信息学 基因表达 

摘      要：湿加松Pinus elliottii×***产脂量高、干形通直、抗逆性强,是我国南方重要的脂材两用人工林造林树种。TIFY基因家族在植物中广泛存在,在植物的生长发育、应对非生物胁迫和激素信号转导网络调控中发挥着重要作用。为了研究TIFY基因家族在湿加松割脂过程中的作用,利用生物信息学方法,在湿加松割脂处理转录组中共鉴定出67个TIFY基因家族成员,并对其理化性质、基因特征、系统进化关系、保守基序、保守结构域及表达模式进行分析。理化性质分析表明,湿加松TIFY蛋白在蛋白质长度、等电点、不稳定性指数等均存在差异,均为亲水性蛋白。亚细胞定位预测表明,多数(60个)TIFY蛋白均定位于细胞核。跨膜结构预测表明,TIFY蛋白均不含有跨膜结构。通过多序列比对和系统进化树结果,将这些成员划分为4个亚家族,包括TIFY(18个)、ZML(7个)、PPD(2个)和JAZ(40个)。保守基序和保守结构域分析结果表明,每个TIFY转录因子都至少有一个TIFY结构域,不同亚家族间有不同的结构域和保守基序特点。基因表达分析显示,56.73%的PpTIFY基因家族成员具有显著表达变化,主要表现为差异上调表达,表明PpTIFY基因家族可能参与应对响应割脂胁迫和树脂生物合成的转录调控。