中华猕猴桃AcNOD基因的生物信息学分析

作     者：王素杰 杨彦萍 师万源 赵文娟 员楠 张汉尧 Wang Sujie;Yang Yanping;Shi Wanyuan;Zhao Wenjuan;Yun Nan;Zhang Hanyao

作者机构：西南林业大学国家林业局西南地区生物多样性保育重点实验室昆明650224 西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室昆明650224 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年第22卷第12期

页      面：3864-3870页

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31760450) 云南省农业基础研究联合专项(2018FG001-038)共同资助 

主　　题：中华猕猴桃 AcNOD基因 蛋白结构 生物信息学 

摘      要：结瘤素(nodulin,NOD)是一类主要存在于根瘤细胞中并参与共生固氮作用的植物基因产物,在豆科植物的其他组织细胞中以及非豆科植物体内都有发现。为了探究NOD基因在中华猕猴桃这类非豆科植物中的作用和功能,本研究对其编码序列进行生物信息学分析。结果显示,该基因编码蛋白的分子式为C_(432)H_(715)N_(131)O_(120)S_(3),含有94个氨基酸残基,等电点pI为10.68,属于疏水蛋白。带正电的残基(Arg+Lys)11个,带负电的残基(Asp+Glu)3个,不稳定系数为14.00,脂肪系数为107.23,总平均亲水性系数为0.395;AcNOD蛋白含有一个ENOD93保守结构域;二级结构显示该蛋白主要由59.57%的α-螺旋、17.02%的无规卷曲、15.96%的延伸链和7.45%的β-转角所组成;三级结构的预测结果显示该蛋白扭曲和折叠较多,亚细胞定位于内质网中,存在4个糖基化位点的12个磷酸化位点,不存在信号肽序列,有两个跨膜区域。进化树分析表明该蛋白与豆科植物结瘤素的同源性很高,初步推测他们有相似或相同的功能。本研究结果为后续深入了解NOD基因在中华猕猴桃乃至其他非豆科植物中的作用机制和生物学功能提供基础资料。