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危重型COVID-19合并非病毒病原体感染的队列研究

A cohort study of critical COVID-19 co-infection with non-viral pathogens

作     者:周艳 任迪 文莎 陈燕宏 桂水清 李颖 ZHOU Yan;REN Di;WEN Sha;CHEN Yanhong;GUI Shuiqing;LI Ying

作者机构:深圳市第二人民医院重症医学科广东深圳518025 

出 版 物:《汕头大学医学院学报》 (Journal of Shantou University Medical College)

年 卷 期:2024年第37卷第2期

页      面:76-80,84页

学科分类:1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基  金:深圳市第二人民医院新冠病毒感染应急临床研究项目(2023xgyj3357003) 

主  题:新型冠状病毒感染 危重型 宏基因组学测序 细菌培养 

摘      要:目的:探讨危重型新型冠状病毒感染(COVID-19)合并非病毒病原体感染的现状。方法:回顾性及前瞻性队列研究。选取2022年12月—2023年10月在深圳市第二人民医院重症监护室住院治疗的危重型COVID-19患者52例,其中2022年12月—2023年1月回顾性队列30例,2023年2月—2023年10月前瞻性队列22例。患者入组3、7、21、30、60、90 d时进行随访,随访内容包括患者病原学检测结果、住院生存时间等。采集入组患者的血液及下呼吸道分泌物样本,分别进行细菌培养及病原宏基因组学测序。结果:52例危重型COVID-19患者中,年龄79 (66,84)岁,男性34例(65.4%),病死率为34.6%(18/52)。混合感染47例(90.4%),其中革兰氏阳性菌27例(51.9%),革兰氏阴性菌29例(55.8%),真菌29例(55.8%)。宏基因组学测序在下呼吸道分泌物(76.9%比57.7%)及血液(46.2%比15.4%)中的非病毒病原体检出率高于分离培养法。下呼吸道样本中,革兰氏阳性菌主要为屎肠球菌(12例)、粪肠球菌(8例)、金黄色葡萄球菌(6例),革兰氏阴性菌主要为铜绿假单胞菌(9例)、肺炎克雷伯菌(9例)、大肠埃希菌(7例)、鲍曼不动杆菌(6例),真菌主要为白色念珠菌(15例)、曲霉(9例)。血液样本中革兰氏阴性菌主要为肺炎克雷伯菌(6例)、铜绿假单胞菌(5例),真菌主要为曲霉(6例)。结论:危重型COVID-19患者常合并细菌、真菌感染。

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