MS4A6A的泛癌分析:基因组特征、免疫浸润和预后

作     者：罗斌 黄小勇 费蕾 杨耀 陈永文 LUO Bin;HUANG Xiaoyong;FEI Lei;YANG Yao;CHEN Yongwen

作者机构：陆军军医大学基础医学院免疫学教研室重庆400038 解放军西部战区总医院药剂科成都610083 

出 版 物：《免疫学杂志》 (Immunological Journal)

年 卷 期：2024年第40卷第2期

页      面：181-187页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100102[医学-免疫学] 10[医学] 

主　　题：MS4A6A 巨噬细胞 甲基化 预后 免疫浸润 

摘      要：目的对4次跨膜蛋白MS4A6A(membrane-spanning 4-domain family,subfamily A,member 6A)在泛癌组织中的转录水平、基因组改变情况、潜在的异常表达机制、预后价值、与免疫细胞及免疫相关基因的关系和潜在的调控机制进行了探索。方法使用生物信息学方法深入分析MS4A6A基因组、MS4A6A表达与免疫细胞浸润相关性及MS4A6A表达与肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性和免疫评分的相关性;基于Spearman相关系数分析免疫评分与MS4A6A表达的相关性。结果1)对33种肿瘤的单因素Cox分析表明,MS4A6A高基因转录是低级别脑胶质瘤(brain lower grade glioma,LGG)、睾丸生殖细胞瘤(testicular germ cell tumors,TGCT)、葡萄膜黑色素瘤(uveal melanoma,UVM)、胸腺瘤(thymoma,THYM)的危险因素;2)大部分肿瘤MS4A6A甲基化水平与其表达呈负相关,提示MS4A6A差异表达可能与其启动子甲基化相关;3)MS4A6A表达与免疫评分在32种肿瘤中呈现显著正相关,且在所有类型肿瘤中与基质评分和ESTIMATE评分均呈现显著正相关;4)MS4A6A表达与肿瘤相关成纤维细胞、调节性T细胞、B细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、单核细胞和CD8+T细胞的浸润呈现正相关。结论MS4A6A可能通过影响免疫系统进一步参与肿瘤进程调控。