獭兔酪氨酸酶相关蛋白1(Tyrp1)基因序列分析及外显子多态性研究

作     者：郝晔 施丽娟 闫晓荣 赵博昊 朱杰 陈阳 翁巧琴 吴信生 

作者机构：扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 江苏省动物繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009 浙江省余姚市欣农兔业有限公司浙江余姚315400 

出 版 物：《安徽农业科学》 (Journal of Anhui Agricultural Sciences)

年 卷 期：2016年第44卷第9期

页      面：164-167,196页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：现代农业产业技术体系建设专项(CARS-44-1) 江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD 2014-134) 

主　　题：獭兔 Tyrp1 SNPs 序列分析 

摘      要：[目的]探索獭兔酪氨酸相关蛋白1(Tyrp1)基因在毛色形成过程中的分子机制。[方法]对獭兔Tyrp1基因序列的核苷酸序列、编码产物的基本理化性质等进行预测和分析,同时利用PCR-SSCP(Single strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products)技术检测Tyrp1基因CDS序列的多态性分布状况。[结果]信息学分析发现,TYRP1蛋白是不稳定的亲水性蛋白,有信号肽,具有酪氨酸酶家族特征性功能结构域。多态性检测发现仅在Tyrp1基因CDS的483 bp处存在1个C→T的同义突变,位于外显子2上,该碱基的突变没有造成氨基酸的改变(AUC→AUT,异亮氨酸)。Hardy-Weinberg平衡检验表明,青紫蓝色獭兔群体处于非平衡状态,白色獭兔群体处于平衡状态。青紫蓝兔群体为中度多态信息含量(0.25PIC0.50),白色獭兔群体为低度多态信息含量(PIC0.25)。[结论]Tyrp1基因对獭兔的毛色有一定的影响。该研究结果可为獭兔毛色的选种选育提供一定的参考。