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问号钩端螺旋体胶原酶结构和功能分析

Structural and functional analysis for collagenase of Leptospira interrogans

作     者:李文俊 余慧峰 杨宏亮 姜叙诚 郭晓奎 

作者机构:上海第二医科大学病理学教研室,上海200025 上海市传染病医院,上海200083 上海第二医科大学微生物学教研室,上海200025 

出 版 物:《世界感染杂志》 (World Journal of Infection)

年 卷 期:2004年第4卷第1期

页      面:9-13页

学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基  金:国家高技术发展计划(863计划)(编号:2001AA2230311) 上海市教委重点学科资助(ZDXK2001) 上海第二医科大学基础医学院合作研究基金(编号:2003JY05) 

主  题:问号钩端螺旋体 胶原酶 生物信息学 核酸序列 

摘      要:目的:研究问号钩端螺旋体(简称问号钩体)致病机理,预测问号钩体胶原酶结构和功能,为进一步实验验证提供线索。方法:利用各种公共核酸及蛋白数据库资源,运用多种生物学软件对钩体胶原酶基因及其编码产物的结构和功能深入分析。结果:对问号钩体胶原酶进行了结构域归类;对其基因、蛋白的一般特性,蛋白一级结构,二级结构和超二级结构等作了对比性分析;对其序列中的部分片段:进行三维结构模拟;并绘制了其分子进化树,分析其垂直进化关系。结论:问号钩体胶原酶和其它多:种致病性微生物胶原酶具有不同层次、程度不等的相似性。它属于锌蛋白酶超家族和M9-蛋白酶家族。它可能在钩体浸润宿主并造成宿主多脏器出血等方面起重要作用。

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