尼泊尔黄堇Aux/IAA基因家族的鉴定与UVB处理下表达模式分析

作     者：梁佳林 赵爽 李幸儿 赵成周 李萍 LIANG Jia-lin;ZHAO Shuang;LI Xing-er;ZHAO Cheng-zhou;LI Ping

作者机构：青海大学生态环境工程学院西宁810016 青海大学藏医学院青海大学藏医药研究中心西宁810016 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2024年第40卷第12期

页      面：182-192页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071001[理学-植物学] 07[理学] 

基　　金：青海省科学技术厅基础研究项目(2022-ZJ-714) 三江源生态一流学科硕士研究生科技创新项目(2024-stxy-Y13) 

主　　题：尼泊尔黄堇 Aux/IAA基因家族 UV-B胁迫 全长转录组 生物信息学 基因表达分析 

摘      要：【目的】鉴定尼泊尔黄堇Aux/IAA基因家族,为尼泊尔黄堇Aux/IAA基因功能研究及抵御逆境胁迫提供理论基础。【方法】基于尼泊尔黄堇全长转录组数据,鉴定和分析尼泊尔黄堇Aux/IAA(ChAux-IAA)基因家族成员,并对其蛋白质理化性质、系统进化树、基因结构、蛋白质三级结构及蛋白质互作关系、启动子顺式作用元件进行分析。此外,对尼泊尔黄堇进行不同时间(0.5 h、48 h)UV-B处理,检测ChAux/IAA基因家族的表达模式。【结果】尼泊尔黄堇ChAux/IAA基因家族共有20个成员,大多数位于细胞核中,少数位于叶绿体、线粒体和细胞壁中。ChAux/IAA基因家族编码蛋白属于亲水性蛋白。ChAux/IAA基因家族的顺式作用元件中存在光响应元件,表明该基因家族可能参与植物的生长发育和抵御紫外胁迫。通过RT-qPCR分析发现,在UV-B处理下,20个ChAux/IAA的表达量均较对照组增加,其中ChIAA2、ChIAA3、ChIAA4、ChIAA10、ChIAA13和ChIAA21表达量增加更加显著,表明ChAux/IAA基因家族在其抵御紫外线胁迫方面具有重要功能。【结论】共鉴定出20个ChAux/IAA基因家族成员,ChAux/IAA基因家族在UV-B胁迫中发挥重要作用。