根皮素对新型冠状病毒RNA聚合酶抑制活性的实验研究及类似物活性预测

作     者：邸琨 谢小华 赵田华 吴巧娜 王宇佳 苏彦雷 孙殿兴 岑山 

作者机构：石家庄市第三医院 河北省人民医院 联勤保障部队第九八〇医院 中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所 

出 版 物：《中华中医药学刊》 (Chinese Archives of Traditional Chinese Medicine)

年 卷 期：2025年

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(NSFC81672041) 河北省卫生健康委重点科研攻关计划(No.20231303) 

主　　题：新型冠状病毒 RNA聚合酶 根皮素 类似物 分子对接 活性测试 

摘      要：目的 探索根皮素对新型冠状病毒RNA聚合酶的抑制活性，并预测3种根皮素类似物小分子的靶酶抑制活性。方法 运用分子对接手段研究根皮素与RNA聚合酶活性位点处的结合模式；利用细胞水平的新型冠状病毒RNA聚合酶nsp7/nsp8/nsp12催化反应体系检测根皮素对RNA聚合酶的抑制活性。选择3种与根皮素结构类似的中药小分子进行靶酶抑制活性预测，应用分子对接方法研究它们与靶酶活性位点间的结合模式。结果 根皮素及其类似物均可较好的结合于RNA聚合酶的活性位点处，占据NTPs通道而阻碍核苷酸底物的进入，进而抑制RNA聚合酶主导的核酸复制。细胞水平上的抑制RNA聚合酶活性测试实验结果表明，根皮素对新型冠状病毒RNA聚合酶具有明显的抑制活性，虽然活性弱于瑞德西韦，但其细胞毒性亦低于瑞德西韦；同时，预测根皮素类似物亦可抑制RNA聚合酶而具有抗新型冠状病毒药理作用。结论 本研究证实根皮素具有RNA聚合酶抑制活性，并预测根皮素类似物小分子亦具有RNA聚合酶抑制活性，结果可进一步为抗新型冠状病毒药物研发提供参考。