基于福建柏转录组数据的WRKY转录因子的鉴定和分析

作     者：杨靖 周成城 徐艳萍 荣俊冬 郑郁善 陈礼光 Yang Jing;Zhou Chengcheng;Xu Yanping;Rong Jundong;Zheng Yushan;Chen Liguang

作者机构：福建农林大学林学院福州350002 福建农林大学园林学院福州350002 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2025年第23卷第1期

页      面：92-98页

学科分类：0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基　　金：福建省林业局种苗科技攻关六期项目(KF2015085)资助 

主　　题：福建柏 WRKY 功能注释 抗逆反应 

摘      要：本研究基于福建柏叶根茎的转录组数据并筛选鉴定福建柏的WRKY转录因子,以期挖掘出参与福建柏生长发育及抗逆反应的WRKY转录因子,为日后利用遗传改良手段调控福建柏生长发育及抗逆反应调节提供理论基础。结果表明,共鉴定出WRKY的数量为61个;亚细胞定位结果表明均定位于细胞核中;GO结果显示与生物过程、分子功能和细胞组分相关的GO terms的数量分别为453、196和128个;61个福建柏WRKY转录因子中的N端和C端的保守基序分别为:-WRKYGQK-,-C-(X4-7)-C-(X22-23)-H(X)H/C-;与拟南芥WRKY转录因子的系统进化树表明,除了Ⅱa、Ⅲb亚家族没有分布,其他亚家族中均有福建柏与拟南芥WRKY转录因子聚为一类。热图分析表明福建柏WRKY转录因子具有组织差异性表达,RT-qPCR的结果验证了部分WRKY基因存在组织差异性表达。