咨询与建议

看过本文的还看了

相关文献

该作者的其他文献

文献详情 >大麦FKBP基因家族的鉴定与表达分析 收藏

大麦FKBP基因家族的鉴定与表达分析

作     者:王月雪 母景娇 耿梓瀚 王孜逸 王艳芳 赵彦宏 

作者机构:鲁东大学农学院 鲁东大学生命科学学院 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2025年

学科分类:09[农学] 0901[农学-作物学] 

基  金:国家自然科学基金面上项目(32272159) 国家重点研发计划项目(2019YFD1005002-0304)共同资助 

主  题:大麦 FKBP基因家族 生物信息学 表达模式分析 

摘      要:FK506结合蛋白(FK506-binding proteins, FKBP)是免疫抑制剂FK506和雷帕霉素的受体蛋白,是一类高度保守的基因家族,在植物的生长发育及逆境胁迫中扮演着重要角色。本研究利用生物信息学的方法在大麦中鉴定出17个大麦HvFKBP基因,根据其在染色体上的位置对其进行命名;进化树分析表明这些成员可分为3个亚组;大麦HvFKBP基因分析结果显示第Ⅰ亚组的内含子数量最多(5~11个),第Ⅱ亚组内含子数量为3~10个,而第Ⅲ亚组的数量则是最少的(1~8个);蛋白保守基序结果表明各亚组间具有类似的基序数量及排列方式;转录组数据分析表明HvFKBP在大麦不同组织中的表达具有差异性,HvFKBP13和HvFKBP14在8个组织中均有较高的表达,而HvFKBP11的表达量极低或者是不表达;盐胁迫处理后,上调表达最明显(1.16)及下调表达最明显((-0.59)的基因均位于根分生区)。大麦HvFKBP基因家族的鉴定为深入研究大麦生长发育和响应胁迫中的分子机制提供一定的有益参考。

读者评论 与其他读者分享你的观点

用户名:未登录
我的评分