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辽宁圈养和野生东北林蛙肠道细菌多样性比较

作     者:张诗琪 贺晨 花语璐 苗子源 李振鑫 董丙君 

作者机构:沈阳师范大学生命科学学院 

出 版 物:《经济动物学报》 (Journal of Economic Animal)

年 卷 期:2025年

学科分类:0908[农学-水产] 09[农学] 

基  金:辽宁省农业农村厅专项(202401) 

主  题:东北林蛙 肠道菌群 野生 圈养 

摘      要:为研究圈养环境与野生环境下的东北林蛙肠道细菌群落结构和功能的差异,于2023年4月-5月采集辽宁地区野生东北林蛙12只,圈养东北林蛙12只,分别取样十二指肠、小肠和大肠3个部位,合计72个样本,采用16 S rDNA高通量测序技术鉴定菌群结构,采用Alpha多样性分析、Beta多样性分析、Anosim分析和聚类分析方法比较两组间菌群差异,结果如下:(1)野生组林蛙肠道优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria),优势菌属为不动杆菌属(Acinetobacter)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)和鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium);圈养组优势菌门为变形菌门、厚壁菌门和拟杆菌门(Bacteroidetes),优势菌属为黄金杆菌属(Chryseobacterium)、希瓦氏菌属(Shewanella)和黄杆菌属(Flavobacterium)。(2)在东北林蛙全肠道中,变形菌门、放线菌门和拟杆菌门均为相对丰度较高的菌门,相对丰度均为野生低于圈养。(3)野生和圈养组东北林蛙整体肠道细菌alpha多样性和beta多样性差异均显著;对野生和圈养东北林蛙的相同肠道部位之间的多样性进行比较,除小肠部位的alpha多样性和直肠部位的beta多样性差异显著外,其余均不显著。本研究结果为东北林蛙的保护工作和健康养殖提供科学依据。

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