单叶蔷薇GRAS转录因子家族鉴定及表达分析

作     者：孔青洋 张晓龙 李娜 张晨洁 张雪云 于超 张启翔 罗乐 KONG Qing-yang;ZHANG Xiao-long;LI Na;ZHANG Chen-jie;ZHANG Xue-yun;YU Chao;ZHANG Qi-xiang;LUO Le

作者机构：北京林业大学园林学院城乡生态环境北京实验室、花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室、教育部园林环境工程研究中心、林木花卉遗传育种教育部重点实验室林木资源高效生产全国重点实验室、国家花卉工程技术研究中心北京100083 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2025年第41卷第1期

页      面：210-220页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家重点研发计划(2023YFD1200105,2019YFD1001001) 中央高校基本科研业务费专项资金(QNTD202306) 国家自然科学基金项目(32071820) 

主　　题：单叶蔷薇 GRAS基因家族 生物信息学分析 表达分析 干旱胁迫 低温胁迫 

摘      要：【目的】对单叶蔷薇(Rosa persica)GRAS基因家族成员进行鉴定及功能分析,为单叶蔷薇GRAS基因家族功能研究及育种应用奠定理论基础。【方法】以单叶蔷薇基因组为研究对象,对单叶蔷薇GRAS基因家族进行成员鉴定、结构分析、进化分析、顺式作用元件分析、GRAS蛋白二级结构、三级结构预测,结合转录组对组织部位、不同水平干旱和低温胁迫环境中基因表达进行分析。【结果】鉴定出42个GRAS基因家族成员,分布在7条不同的染色体上;42个RbGRAS基因可分为9个亚族;基因结构分析表明RbGRAS基因具有保守的N端,而C端在结构上较多变;对基因家族成员共线性分析显示,有4对片段重复基因和4对串联重复基因;顺式作用元件分析发现,单叶蔷薇GRAS基因家族中含有丰富的激素应答元件和胁迫响应元件;RbGRAS蛋白二级预测结构以α-螺旋以及无规则卷曲为主,三级预测结果显示蛋白组成相似;组织特异性表达分析结果显示GRAS基因主要在根系和茎组织中表达,在花中表达量较低;RbGRAS基因在干旱和低温胁迫中也存在基因特异性表达。【结论】鉴定得到42个RbGRAS家族成员,均含有逆境相关作用元件,RbGRAS27和RbGRAS41分别对干旱和低温胁迫积极响应。