牦牛Akirin1基因克隆、生物信息学及组织表达分析

作     者：马荣 路建卫 赵雪 扎老 成述儒 喇永福 吴晓云 包鹏甲 郭宪 梁春年 MA Rong;LU Jianwei;ZHAO Xue;ZHA Lao;CHENG Shuru;LA Yongfu;WU Xiaoyun;BAO Pengjia;GUO Xian;LIANG Chunnian

作者机构：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃省牦牛繁育工程重点实验室甘肃兰州730050 甘肃农业大学甘肃兰州730070 合作市农畜产品质量安全检测检验中心甘肃合作747000 合作市佐盖多玛乡畜牧站甘肃合作747000 

出 版 物：《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)

年 卷 期：2024年第39卷第S1期

页      面：267-273页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 0905[农学-畜牧学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：合作市牦牛种质提升与提质增效项目 现代肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37) 甘肃省基础研究创新群体项目(20JR5RA580) 甘肃省科技重大专项(21ZD10NA001 GZGG-2021-1) 中国农业科学院创新工程(25-LIHPS-01) 

主　　题：牦牛 Akirin1基因 克隆 生物信息学分析 组织表达分析 

摘      要：为探究牦牛Akirin1基因的序列特征,详细了解其组织表达特性。以甘南牦牛肌肉组织cDNA为模板,利用RT-PCR技术克隆甘南牦牛Akirin1基因CDS序列,并使用多种生物在线软件及工具进行生物信息学分析,再利用qPCR技术检测Akirin1基因在甘南牦牛心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪和睾丸组织中表达差异。结果显示,甘南牦牛Akirin1基因CDS长579 bp,共编码192个氨基酸,基因编码的蛋白分子式为C_(964)H_(1525)N_(275)O_(291)S_(8),蛋白理论等电点为8.91,不稳定系数和总平均亲水性分别为84.14,-0.822,属于不稳定亲水性蛋白;蛋白潜在磷酸化位点有29个,分别为14个丝氨酸,11个苏氨酸和4个酪氨酸;无信号肽和跨膜螺旋结构,亚细胞定位显示,主要存在于细胞核中,属于非分泌型蛋白;蛋白高级结构主要由39.06%的α-螺旋和56.25%的无规则卷曲结构组成。同源性分析比对牦牛与普通牛亲缘关系最近,符合实际情况,说明Akirin1基因在进化过程中相对具有一定保守性。实时荧光定量结果显示,Akirin1基因在成年甘南牦牛心、肝、脾、肺、肾、肌肉和脂肪组织均有所表达,而在肾脏组织中相对表达最多,显著高于其他组织,在肌肉和肝脏组织中表达相对较少。本试验为进一步研究牦牛Akirin1基因功能特征提供一定的理论基础。