细菌单细胞测序技术研究进展

作     者：刘毛毛 陈欢 高原 赵蓓蓓 荣雅文 黄俊 LIU Maomao;CHEN Huan;GAO Yuan;ZHAO Beibei;RONG Yawen;HUANG Jun

作者机构：浙江科技大学生物与化学工程学院浙江杭州310023 浙江中医药大学生命科学学院浙江杭州310053 杭州微数生物科技有限公司浙江杭州311215 

出 版 物：《微生物学通报》 (Microbiology China)

年 卷 期：2025年第52卷第1期

页      面：101-113页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：国家重点研发计划(2021YFF0600805) 

主　　题：细菌 单细胞测序 细菌感染 转录组 

摘      要：细菌群体中细胞间的异质性是决定细菌耐药性和毒力上的关键因素,并在宿主与病原体间的相互作用中起着至关重要的作用,为细菌性感染病的防治带来了重大挑战。单细胞测序是检测细胞异质性的有力工具,但由于细菌独特的生物学特性,如基因组较小、mRNA含量低、半衰期短、无PolyA尾、转录组中rRNA占比高和细胞壁厚等,使得基于真核细胞的单细胞测序方法不能应用于细菌。为了克服这些障碍并促进单细胞技术在细菌研究领域的发展,研究人员成功研发了适用于细菌的单细胞测序方法。本文系统综述了近年来提出的细菌单细胞转录组测序和基因组测序技术,描述了其特点并着重分析了这些技术在揭示细菌耐药性方面的应用,旨在为相关研究提供新的视角。细菌单细胞测序可以深入揭示细菌异质性,提高疾病诊断和治疗的准确性,为细菌学和感染病学的研究提供支持。