细胞色素P460的基因表达及生物学特征分析

作     者：洪跃辉 范红弟 谭琼 王江海 HONG Yuehui;FAN Hongdi;TAN Qiong;WANG Jianghai

作者机构：广东江门中医药职业学院江门市中药成分及其作用机制重点实验室/江门市健康产品工程技术研究中心广东江门529000 中山大学海洋科学学院广东珠海519082 

出 版 物：《生物化工》 (Biological Chemical Engineering)

年 卷 期：2024年第10卷第6期

页      面：7-13,20页

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 07[理学] 

基　　金：广东省普通高校重点领域专项(2022ZDZX4116) 2022年度江门市基础与理论科学研究类科技计划项目(126) 广东江门中医药职业学院2023年度院级科技计划项目和科研创新团队项目([科]JMZYYKY20232004,[科创团]JMZYYKCT20233001) 

主　　题：细胞色素P460 生物信息学 跨膜区 信号肽 三级结构 

摘      要：目的:检测Paraburkholderia fungorum Gan-35的细胞色素P460在氨氮培养基中的基因表达,剖析该细胞色素P460的生物学特征。方法:采用荧光定量PCR检测基因表达,利用生物信息学方法分析生物学特征,分析内容包括系统进化树、理化参数、开放阅读框、亲疏水性、跨膜区、信号肽、二级结构、三级结构和功能域。结果:该细胞色素P460在氨氮培养基中的基因表达量是对照组的2.33倍,基因序列与Paraburkholderia fungorum的相应序列亲缘关系较近,含有354个氨基酸残基,属于中等分子量蛋白质,理论等电点为10.84,亲水性平均系数为0.295,含有9个开放阅读框。该P460有较多区域表现为疏水性,有4个跨膜区,缺乏信号肽,其二级结构成分包括α螺旋(49.44%)、延伸链(12.15%)、β-转角(9.04%)和无规卷曲(29.37%)。三级结构与细胞色素P450区别明显。结论:该细胞色素P460在含氨氮培养基中受到诱导表达,生物学分析结果为后续深入研究细胞色素P460的功能及其应用奠定了基础。