内蒙古白绒山羊TSC2基因克隆与表达模式分析

作     者：史偈君 杨娇馥 张涛 秦毅 谢鸿云 李树裕 郝喜燕 王志钢 Shi Jiejun;Yang Jiaofu;Zhang Tao;Qin Yi;Xie Hongyun;Li Shuyu;Hao Xiyan;Wang Zhigang

作者机构：内蒙古大学生命科学学院呼和浩特010021 同济大学生命科学与技术学院上海200092 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2012年第28卷第2期

页      面：85-89页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31160469) 内蒙古自然基金项目(2011MS0521) 

主　　题：内蒙古白绒山羊 TSC2 表达模式 

摘      要：旨在克隆内蒙古白绒山羊TSC2基因cDNA并分析其特性及基本表达模式。利用RT-PCR分段克隆TSC2基因cDNA片段并测序,将得到的cDNA各片段核苷酸序列拼接后获得绒山羊TSC2基因编码区全长序列(HQ684023)并进行生物信息学分析。半定量RT-PCR方法检测TSC2基因在不同组织中的表达特异性。结果表明内蒙古白绒山羊TSC2基因cDNA编码区核苷酸序列为5 184 bp,包含了编码1 727个氨基酸残基的全长ORF。核苷酸序列与牛、猪、马、大熊猫、犬、恒河猴、人、小鼠及大鼠的同源性分别为97%、90%、89%、88%、87%、87%、87%、86%和86%。NCBI CDD程序预测该基因编码的蛋白质有一个Tuberin结构域和一个Rap-GAP结构域;Psite程序分析有5个N糖基化位点、2个cAMP和cGMP依赖蛋白激酶磷酸化位点、16个蛋白激酶C磷酸化位点、25个酪蛋白激酶磷酸化位点。PSORT程序预测其定位于胞内体膜。TSC2基因在内蒙古白绒山羊的睾丸、脑、肝脏、肺、乳腺、脾和肾脏等组织中都有表达,mRNA丰度在睾丸中较高,乳腺中较低。