麻鸭和樱桃谷鸭的CD3ε、CD4、CD8α基因ORF克隆及序列分析

作     者：李卫 白家媛 许媛媛 谷长勤 张万坡 程国富 陈敏 胡薛英 LI Wei;BAI Jia-yuan;XU Yuan-yuan;GU Chang-qin;ZHANG Wan-po;CHENG Guo-fu;CHEN Min;HU Xue-ying

作者机构：华中农业大学动物医学院 

出 版 物：《中国农业科学》 (Scientia Agricultura Sinica)

年 卷 期：2009年第42卷第12期

页      面：4428-4434页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：湖北省科技攻关课题(2006AA202A05) 

主　　题：CD3ε CD4 CD8α 序列分析 同源性 

摘      要：【目的】分析比较中国部分品种鸭的CD3ε、CD4和CD8α基因ORF序列,为研究CD3ε链、CD4和CD8α链的结构和功能及其抗体的应用提供依据。【方法】利用RT-PCR,对麻鸭、樱桃谷鸭的CD3ε、CD4和CD8α基因ORF序列克隆测定,应用Clustal(X1.83)和DNAstar生物学软件分别与GenBank上公布的北京鸭CD3ε(AF378704)、CD4(AF378701)和CD8α(AF378373)基因ORF序列进行序列分析。【结果】麻鸭、樱桃谷鸭、北京鸭CD3ε和CD4基因ORF序列及所编码的氨基酸同源性为99%;北京鸭和麻鸭CD8α基因ORF序列同源性为99%,与樱桃谷鸭的同源性为95%。麻鸭和北京鸭CD8α基因ORF序基因编码的氨基酸完全一致,与樱桃谷鸭的CD8α存在16处位点差异,其中胞外区有15个氨基酸的差异,使亲水性、抗原性以及此区域位于蛋白质表面的可能性都有明显差异。从遗传发生树得出樱桃谷鸭、北京鸭、麻鸭CD3ε和CD4的ORF序列相互之间的遗传关系近;樱桃谷鸭、麻鸭和北京鸭CD8α基因ORF序列之间的遗传关系较远。【结论】樱桃谷鸭、北京鸭、麻鸭CD3ε和CD4的ORF序列遗传变异性低,樱桃谷鸭与麻鸭和北京鸭CD8α基因ORF之间具有较高遗传变异性。