炭疽芽胞杆菌中CRISPR位点

作     者：高志奇 王东澍 冯尔玲 王秉翔 惠一鸣 韩少波 焦磊 刘先凯 王恒樑 

作者机构：军事医学科学院生物工程研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 兰州生物制品研究所有限责任公司甘肃兰州730046 

出 版 物：《微生物学报》 (Acta Microbiologica Sinica)

年 卷 期：2014年第54卷第11期

页      面：1362-1368页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：传染病重大专项(2012ZX10004215) 国家自然科学基金(81271785,81125012) 

主　　题：规律成簇间隔短回文重复序列 炭疽芽胞杆菌 分子分型 

摘      要：【目的】考察炭疽芽胞杆菌中规律成簇的间隔短回文序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)位点多态性情况及基于CRISPR位点多态性的分子分型方法是否在炭疽芽胞杆菌分型中适用。【方法】下载NCBI数据库中6株炭疽芽胞杆菌基因组并截取其中CRISPR位点片段序列。根据炭疽芽胞杆菌内CRISPR位点信息,设计相关引物,以193株炭疽芽胞杆菌基因组为模板PCR扩增CRISPR位点片段,测序。本地Blast比对截取序列及测序结果,查看CRISPR位点在炭疽芽胞杆菌中的多态性情况,并比较炭疽芽胞杆菌与蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌内CRISPR位点情况。【结果】炭疽芽胞杆菌内CRISPR位点不存在多态性。【结论】基于CRISPR位点多态性的分子分型方法不适用于炭疽芽胞杆菌分型,但可以用于区分炭疽芽胞杆菌与蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌。