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日本晴与5个优良恢复系的多态性标记筛选及遗传差异分析

Polymorphic SSR Markers Screening and Genetic Difference Analysis Between Nipponbare and Five Excellent Restorer Lines

作     者:赵芳明 郭超 魏霞 杨正林 凌英华 桑贤春 王楠 张长伟 李云峰 何光华 

作者机构:西南大学水稻研究所/农业部西南作物遗传改良与育种重点开放实验室重庆400715 

出 版 物:《西南大学学报(自然科学版)》 (Journal of Southwest University(Natural Science Edition))

年 卷 期:2016年第38卷第11期

页      面:1-7页

学科分类:09[农学] 0901[农学-作物学] 

基  金:重庆市科技攻关计划重点项目(CSTC2012ggC80002) 

主  题:SSR标记 多态性 日本晴 恢复系 遗传差异 

摘      要:遗传基因的分离需要供、受体亲本间较大的遗传差异.该文利用均匀分布于水稻12条染色体的429个SSR标记,分析了日本晴与5个自育优良恢复系之间的多态性标记及分布密度,进而评价它们间的遗传差异性.结果显示,日本晴与西恢18号、缙恢35、R225、R232和R250之间的多态性标记数分别为263,253,253,255和240个;多态率分别为61.31%,58.97%,58.97%,59.44%和55.94%;每个标记间的平均物理距离分别为1.59,1.61,1.62,1.62和1.72 Mb.每个SSR位点可检测到的等位基因数目为2~5个,平均每对SSR引物检测到2.35个等位基因.各亲本之间的遗传距离在0.121 7~0.896 7之间,日本晴与5个恢复系间的平均遗传距离为0.857 6.聚类分析也将日本晴与5个恢复系分为两大亚类,表明它们之间存在极大的遗传差异.这些材料和结果对水稻遗传基因的分离具有重要意义.

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