北柴胡皂苷生物合成途径关键酶IPPI的全长cDNA克隆及其序列分析

作     者：隋春 战晴晴 魏建和 陈怀琼 杨成民 郑亭亭 SUI Chun;ZHAN Qing-qing;WEI Jian-he;CHEN Huai-qiong;YANG Cheng-min;ZHENG Ting-ting

作者机构：中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 东北林业大学生命科学学院黑龙江哈尔滨150040 

出 版 物：《中草药》 (Chinese Traditional and Herbal Drugs)

年 卷 期：2010年第41卷第7期

页      面：1178-1184页

核心收录：

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：国家科技支撑计划重点项目(2006BAI09B01) 中央级院所长科研基金项目(YZ-1-10) 

主　　题：北柴胡 柴胡皂苷 异戊烯基焦磷酸异构酶(IPPI) cDNA文库 PCR矩阵法 

摘      要：目的克隆北柴胡皂苷生物合成途径关键酶异戊烯基焦磷酸异构酶(EC 5.3.3.2,isopentenyl diphosphate isomerase,IPPI)的全长cDNA,为研究柴胡皂苷的生物合成与基因调控奠定基础。方法 PCR矩阵法快速筛选北柴胡全长cDNA文库。结果获得了北柴胡IPPI的全长cDNA(GenBank ***433719),其核苷酸序列长1 117bp,编码319个氨基酸的蛋白。NCBI Blastx结果显示与胡萝卜Daucus ***(abb52064)的IPPI氨基酸序列相似性最高,一致性为92%,相似度为97%。保守结构域搜索显示含有IPPI共有的催化活性位点、金属结合位点及Nudix基序。TargetP1.1和SignalP3.0分析表明北柴胡IPPI N端含有长26 bp的叶绿体信号肽。结论首次克隆了北柴胡IPPI的全长cDNA,将促进后续北柴胡IPPI基因表达特性及其在柴胡皂苷合成代谢中功能的研究。