猪肌生成抑制素基因去信号肽蛋白二级构预测和B细胞表位分析

作     者：金定恩 张力青 姚艳丰 韩丽 梁爱心 滑国华 杨利国 Jin Dingen;Zhang Liqing;Yao Yanfeng;Han Li;Liang Aixin;Hua Guohua;Yang Liguo

作者机构：华中农业大学动物科技学院农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2008年第24卷第S1期

页      面：264-270页

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 0905[农学-畜牧学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金(30270959)资助 

主　　题：猪 MSTN 蛋白二级结构 B细胞表位 

摘      要：目的预测猪肌生成抑制素去信号肽蛋白的二级结构和B细胞优势抗原表位,为生产该蛋白的单克隆抗体、建立噬菌体抗体库、研制针对该基因的表位多肽疫苗、表位核酸疫苗等奠定基础。方法根据猪肌生成抑制素去信号肽蛋白氨基酸序列,应用7种参数和方法分析预测二级结构和抗原表位,包括Garnier-Robson、Chou-Fasman、Karplus-Schulz、Kyte-Doolittle、Emini、Jameson-Wolf及吴氏综合预测方法。结果MSTN去信号肽蛋白存在多个潜在的抗原表位位点,其中B细胞抗原优势表位可能在1-11、41-55、57-64、62-90、99-104、138-144、193-200、202-212、235-243区段或其附近,此结果将为进一步鉴定和合成多肽疫苗和表位核酸疫苗制备抗猪MSTN蛋白抗体提供依据,并为研究MSTN结构和功能奠定基础。