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具有遗传性疾病和性状的遗传位点分析

Genetic Loci Analysis of Inherited Diseases and Traits

作     者:方兴 毕嘉琳 邢传智 张承进 FANG Xing;BI Jialin;XING Chuanzhi;ZHANG Chengjin

作者机构:山东大学(威海)机电与信息工程学院山东威海264209 山东大学(威海)数学与统计学院山东威海264209 

出 版 物:《数学建模及其应用》 (Mathematical Modeling and Its Applications)

年 卷 期:2017年第6卷第4期

页      面:50-60页

学科分类:02[经济学] 0202[经济学-应用经济学] 020208[经济学-统计学] 07[理学] 0714[理学-统计学(可授理学、经济学学位)] 070103[理学-概率论与数理统计] 0701[理学-数学] 

主  题:Logistic回归分析 主成分分析 典型相关分析 遗传统计学 全基因组关联性分析(GWAS) 位点(SNPs) 

摘      要:为便于进行数据分析,首先将数据中的位点信息由原来字母编码方式转换为数值编码的方式,根据位点的编码信息和患病信息,采用Logistic回归的方法,找出某种疾病最有可能的一个或几个致病位点,同时采用显著性检验进一步对建立的模型进行检验,证明了建立结果的合理性。此外,通过主成分分析,从原有的300个主成分中取出了225个主成分尽可能多地反映原来基因变量的信息,再通过主成分Logistic回归分析找出与疾病最有可能相关的一个或几个基因。最后,采用典型相关分析找出与相关性状有关联的基因位点。

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