基于lncRNA的癌症风险通路识别研究

作     者：杨海秀 许艳军 尚德思 

作者机构：哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 

出 版 物：《世界最新医学信息文摘》 (World Latest Medicine Information)

年 卷 期：2018年第61期

页      面：15-16页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：黑龙江省卫生计生委科研课题(2014-416) 

主　　题：长链非编码RNA 通路 癌症 

摘      要：长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)从不同层面调控基因的表达水平,广泛的参与了肿瘤的发生发展过程。本研究从系统生物学的角度,大规模整合lncRNA-mRNA的调控关系,同时结合癌症相关的lncRNA表达信息以及通路的拓扑结构信息,精确定位lncRNA调控的癌症风险通路。并将该方法分别应用于一套乳腺癌数据以及一套结直肠癌数据,识别的显著风险通路大部分通过基因通路富集分析方法得到了验证。此外该方法特异识别的显著风险通路经文献证实与癌症相关,表明基于lncRNA识别癌症风险通路是有效的,可以作为基因通路富集分析方法的补充,为lncRNA在癌症中的调控机制研究提供新的思路。