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芹菜NHL-like蛋白基因克隆与表达分析

Cloning and Expression Pattern Analysis of NHL-like Protein Gene in Celery

作     者:李岩 王枫 谭国飞 贾晓玲 蒋倩 熊爱生 LI Yan;WANG Feng;TAN Guo-fei;JIA Xiao-ling;JIANG Qian;XIONG Ai-sheng

作者机构:南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业部华东地区园艺作物生物学与种质创新重点实验室南京210095 

出 版 物:《植物遗传资源学报》 (Journal of Plant Genetic Resources)

年 卷 期:2014年第15卷第4期

页      面:788-794页

核心收录:

学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基  金:江苏省双创计划 江苏高校优势学科建设工程 江苏省杰出青年基金项目 国家教育部新世纪优秀人才支持计划 国家自然科学基金项目 

主  题:芹菜 NHL-like蛋白 基因克隆 荧光定量PCR 表达分析 

摘      要:植物生长发育过程中会遭遇各种病原物的攻击,植物为了应对这些危害并适应外界的生存竞争,逐渐演化出了复杂的防御机制.NHL基因家族庞大,部分NHL基因受病原物诱导后会过量表达,增强植物对多种病原菌的抗性,是与植物防御机制密切相关的蛋白.本研究以津南实芹和美国西芹2个芹菜品种为试验材料,分别克隆出NHL-like蛋白基因AgNHL.序列分析表明,上述2种芹菜的AgNHL基因序列均含636 bp的开放阅读框,编码211个氨基酸.2种芹菜碱基序列,只有第36位不同,津南实芹为T,美国西芹为C,2种碱基序列相似性高达99.84%,编码的氨基酸序列相同.进化分析显示,2种芹菜的NHL-like蛋白与葡萄、大豆等植物的相似度较高,在第80~185氨基酸间含一个LEA_2蛋白保守结构域.荧光定量PCR结果表明,AgNHL基因主要在芹菜茎中表达,根中表达量最低,有明显组织特异性,品种差异也很显著.对2种芹菜分别进行4℃低温、38℃高温、20% PEG处理、0.2 mol/L NaCl处理2h表达分析显示,低温、盐处理下该基因表达量明显上升.

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