登革病毒中国株E基因重组的生物信息学分析

作     者：涂增 刘利成 白志军 方美玉 陈唯军 TU Zeng;LIU Licheng;BAI Zhijun;FANG Meiyu;CHEN Weijun

作者机构：重庆医科大学基础医学院病原生物学教研室重庆400016 中国科学院北京基因组研究所北京101300 广州医学研究所广州510507 

出 版 物：《重庆医科大学学报》 (Journal of Chongqing Medical University)

年 卷 期：2012年第37卷第1期

页      面：67-70页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：重庆医科大学院青年教师科研基金资助项目(编号:0800280002) 

主　　题：RDP3 登革热 E基因 遗传重组 

摘      要：目的:了解我国登革病毒(Dengue virus,DV)包膜蛋白基因(Envelope,E)重组的发生情况。方法:从GenBank收集共70个DV中国株的E基因序列,Clustal-W比对后,重组检测软件包RDP3检测E基因中可能存在的重组事件,并经Mega4构建系统发生树验证所检测的重组事件的可靠性和真实性。结果:DV-1型中E基因区存在3个重组事件,共4个重组子,分别是1995、1997、1999年和2004年分离的DV病毒株,在其它3个血清型的DV病毒株中没有检测到重组,也未检测到血清型间重组。结论:我国DV 1型血清型E基因区域存在基因重组。