三种烟草品种基因组DNA傅里叶红外光谱研究

作     者：邱璐 杨海艳 杨春胜 刘鹏 范树国 刘仁明 周林宗 QIU Lu;YANG Hai-yan;YANG Chun-sheng;LIU Peng;FAN Shu-guo;LIU Ren-ming;ZHOU Lin-zong

作者机构：楚雄师范学院化学与生命科学系云南楚雄675000 楚雄师范学院数学系云南楚雄675000 楚雄师范学院电子与物理科学系云南楚雄675000 楚雄师范学院地理系云南楚雄675000 

出 版 物：《光谱学与光谱分析》 (Spectroscopy and Spectral Analysis)

年 卷 期：2014年第34卷第4期

页      面：967-971页

核心收录：

学科分类：081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 070302[理学-分析化学] 0703[理学-化学] 

基　　金：云南省重点建设学科项目(05YJJSXK03) 云南省高校科技创新团队项目(IRTSTYN) 云南省高校应用生物学重点实验室项目 国家自然科学基金项目(11064001)资助 

主　　题：傅里叶红外光谱(FTIR) 烟草 主成分分析 系统聚类 亲缘关系 Nicotiana tabacum L 

摘      要：利用傅里叶红外光谱(FTIR)研究三种烟草品种DNA的差异,旨在对烟草品种进行亲缘关系分析和品种鉴定。研究结果显示,三种烟草品种DNA红外光谱较为相似,均有四个明显的特征峰,1 103 cm^(-1)是DNA磷酸二酯键的对称伸缩振动,1 236 cm^(-1)是DNA磷酸二酯键的非对称伸缩振动,1 400 cm^(-1)是DNA糖苷键的伸缩振动,I 622 cm^(-1)是DNA中是胞嘧啶C4—C5=C6的环伸缩振动。通过平滑、标准化处理、二阶求导、提取主成分和系统聚类分析建立了DNA FTIR光谱数据聚类分析模型。使用该模型对三个烟草品种进行鉴定,鉴定正确率为100%。使用该模型对三个烟草品种进行亲缘关系分析,云烟87与K326聚为一类,距离系数为0.003,DNA相似度为99.7%,红大单独聚为一类。聚类正确率达100%。该项研究为烟草品种鉴定及遗传育种提供了参考。