HuLDO:人类肝脏疾病本体的构建及应用

作     者：杨春媛 李满生 朱云平 YANG Chun-yuan;LI Man-sheng;ZHU Yun-ping

作者机构：北京协和医学院中国医学科学院基础医学研究所北京100730 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心北京102206 

出 版 物：《军事医学》 (Military Medical Sciences)

年 卷 期：2015年第39卷第2期

页      面：111-116页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

基　　金：国家973计划资助项目(2011CB910600 2013CB911200) 国家863计划资助项目(2012AA020409 2012AA020201) 国家自然科学基金资助项目(201105121 21275160) 

主　　题：生物医学本体 肝脏疾病 数据库构建 文本挖掘 生物信息学 

摘      要：目的中国是多种常见肝病的高发国家,肝脏疾病的研究对提高防治水平,保障人民健康有着重要的意义。为了全面收集、整理、共享和分析分散于现有数据库和文献资料中的肝脏生理病理学知识,该研究构建了人类肝脏疾病本体HuL DO并展开多方面应用。方法 HuL DO是参考疾病相关的多个权威术语集和肝脏病学专著而构建的,依据该本体中的疾病名称列表,从现有数据库中收集各种肝病的相关数据,以本体结构为数据组织框架构建肝病知识库,以本体为字典挖掘肝病与基因的关系。结果 HuL DO是目前最全面的肝病概念分类系统,以该本体为基础建立了一整套肝病知识的收集、挖掘和展示的工具和策略。结论 HuL DO是全面收集、高效分享和灵活分析各类肝病数据和知识的重要工具。肝病本体的下载地址是ftp://***/***%20Disease%20Ontology/。