玉米ZmSSIV基因的序列变异及其对淀粉理化特性的影响

作     者：徐暑晖 杨泽峰 XU Shuhui;YANG Zefeng

作者机构：扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心/教育部植物功能基因组学重点实验室江苏扬州225009 

出 版 物：《扬州大学学报（农业与生命科学版）》 (Journal of Yangzhou University：Agricultural and Life Science Edition)

年 卷 期：2015年第36卷第3期

页      面：54-61页

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：江苏省大学生实践创新训练计划项目(201311117035Z) 

主　　题：玉米 淀粉糊化和热力学特性 ZmSSIV基因 序列变异 关联分析 

摘      要：玉米淀粉合成酶IV(ZmSSIV)基因编码淀粉生物合成途径中一个至关重要的合成酶。为检测ZmSSIV基因序列变异对玉米淀粉品质的影响,对80份玉米自交系中的该基因进行了目标序列重测序,并分别用快速黏度分析仪和差示扫描量热仪测定淀粉的7个糊化特性和4个热力学特性。在玉米的ZmSSIV基因的全长序列中共检测到175个变异,包括150个SNP和25个InDel。尽管内含子具有更高的序列变异频率,编码区的变异依然可以将该基因划分成8种单倍型,并且编码6种不同的ZmSSIV蛋白质。进一步对ZmSSIV基因的序列变异与玉米淀粉的糊化和热力学特性进行了关联分析,结果发现编码区中的2个非同义突变与峰值黏度(PV)、低谷黏度(TV)、衰减值(BD)、峰值温度(Tp)、起始温度(To)和终止温度(Tc)等6个淀粉理化特性存在显著关联。这表明,玉米ZmSSIV基因不仅存在丰富的变异,而且其变异与淀粉理化特性存在显著关联。