基于转录组测序的银杏类黄酮生物合成关键基因表达分析

作     者：刘伟 王俊燚 李萌 董金金 何崇单 汪贵斌 郁万文 王义强 LIU Wei;WANG Jun-yi;LI Meng;DONG Jin-jin;HE Chong-dan;Wang Gui-bin;Yu Wan-wen;WANG Yi-qiang

作者机构：中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室湖南长沙410004 南京林业大学林学院江苏南京210037 

出 版 物：《中草药》 (Chinese Traditional and Herbal Drugs)

年 卷 期：2018年第49卷第23期

页      面：5633-5639页

核心收录：

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金："十三五"国家重点研发计划专项(2017YFD0600701) 国家自然科学基金项目(31570682) 

主　　题：银杏 转录组 类黄酮 黄酮醇 Illumina HiSeq 2000 

摘      要：目的对银杏进行转录组测序,分析银杏生长发育不同时期类黄酮生物合成关键基因的表达。方法以银杏幼年树和成年树不同时期叶片作为供试材料,利用Illumina HiSeq 2000进行转录组测序,对Unigene进行功能注释,分析银杏类黄酮生物合成关键基因的表达特征。结果转录组测序共获得43 073条Unigene,其中35 179条被注释,基因差异表达(DEG)筛选得到5 117个基因。通过对类黄酮合成相关KEGG途径进行分析,筛选出50条候选基因。分析50条候选基因的表达规律,发现类黄酮合成关键基因均在银杏幼叶中高表达,但在成年树与幼年树同时期叶片之间表达差异不显著。分析与类黄酮合成关系密切的13个基因发现,其中肉桂酸4-羟化酶(C4H)、查耳酮合成酶(CHS)、花青素合成酶(ANS)、花青素还原酶(ANR)和类黄酮O-甲基转移酶(FOMT)基因的表达量较高,类黄酮3′-羟化酶(F3′H)、类黄酮3′,5′-羟化酶(F3′5′H)和黄酮醇合成酶(FLS)基因的表达量则相对较低。结论通过转录组高通量测序,筛选分析了银杏类黄酮生物合成的关键基因及其表达特征,为提高银杏类黄酮产量提供了分子生药学理论基础。